RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551920.1

GCN1-209, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-209ENST00000551920 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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GCN1-209ENST00000551920 TRIM37O94972 964 aa22.08■■□□□ 1.13
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GCN1-209ENST00000551920 SBF2Q86WG5 1849 aa22.07■■□□□ 1.12
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GCN1-209ENST00000551920 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.06■■□□□ 1.12
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GCN1-209ENST00000551920 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.04■■□□□ 1.12
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GCN1-209ENST00000551920 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.03■■□□□ 1.12
GCN1-209ENST00000551920 CFAP53Q96M91 514 aa22.03■■□□□ 1.12
GCN1-209ENST00000551920 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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GCN1-209ENST00000551920 BAG6P46379 1132 aa21.95■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.95■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 BTAF1O14981 1849 aa21.94■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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GCN1-209ENST00000551920 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.93■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.93■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 RREB1Q92766 1687 aa21.93■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.93■■□□□ 1.1
GCN1-209ENST00000551920 NUDCQ9Y266 331 aa21.93■■□□□ 1.1
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GCN1-209ENST00000551920 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.89■■□□□ 1.09
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GCN1-209ENST00000551920 ITGB4P16144 1822 aa21.87■■□□□ 1.09
GCN1-209ENST00000551920 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.86■■□□□ 1.09
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GCN1-209ENST00000551920 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.85■■□□□ 1.09
GCN1-209ENST00000551920 DCAF5Q96JK2 942 aa21.85■■□□□ 1.09
GCN1-209ENST00000551920 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.84■■□□□ 1.09
GCN1-209ENST00000551920 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.84■■□□□ 1.09
GCN1-209ENST00000551920 MRC1P22897 1456 aa21.83■■□□□ 1.09
GCN1-209ENST00000551920 ANP32CO43423 234 aa21.83■■□□□ 1.09
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GCN1-209ENST00000551920 PIGBQ92521 554 aa21.83■■□□□ 1.09
GCN1-209ENST00000551920 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.83■■□□□ 1.09
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GCN1-209ENST00000551920 MAP3K5Q99683 1374 aa21.82■■□□□ 1.08
GCN1-209ENST00000551920 LY75O60449 1722 aa21.81■■□□□ 1.08
GCN1-209ENST00000551920 TXNRD1Q16881 649 aa21.81■■□□□ 1.08
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GCN1-209ENST00000551920 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.8■■□□□ 1.08
GCN1-209ENST00000551920 LGR6Q9HBX8 967 aa21.8■■□□□ 1.08
GCN1-209ENST00000551920 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.8■■□□□ 1.08
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GCN1-209ENST00000551920 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.79■■□□□ 1.08
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GCN1-209ENST00000551920 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.74■■□□□ 1.07
GCN1-209ENST00000551920 ATG3Q9NT62 314 aa21.74■■□□□ 1.07
GCN1-209ENST00000551920 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.73■■□□□ 1.07
GCN1-209ENST00000551920 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.73■■□□□ 1.07
GCN1-209ENST00000551920 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
GCN1-209ENST00000551920 NFE2L2Q16236 605 aa21.71■■□□□ 1.07
GCN1-209ENST00000551920 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.71■■□□□ 1.07
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