RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 NEUROD2Q15784 382 aa10.77□□□□□ -0.69
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CS-216ENST00000549221 GLI3P10071 1580 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 LRP5O75197 1615 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 ATRNO75882 1429 aa10.76□□□□□ -0.69
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CS-216ENST00000549221 PKD1L3Q7Z443 1732 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 SHANK3Q9BYB0 1731 aa10.76□□□□□ -0.69
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CS-216ENST00000549221 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
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CS-216ENST00000549221 IFFO2Q5TF58 517 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 WWC1Q8IX03 1113 aa10.73□□□□□ -0.69
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CS-216ENST00000549221 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 MAP3K5Q99683 1374 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 TNS2Q63HR2 1409 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 PHKG2P15735 406 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
CS-216ENST00000549221 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.692e-6■■□□□ 11.9
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CS-216ENST00000549221 AKAP4Q5JQC9 854 aa10.7□□□□□ -0.7
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CS-216ENST00000549221 IL17REQ8NFR9 667 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 LGR6Q9HBX8 967 aa10.7□□□□□ -0.7
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CS-216ENST00000549221 LMOD3Q0VAK6 560 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 WDR63Q8IWG1 891 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 IFNL2Q8IZJ0 200 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
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CS-216ENST00000549221 RNMTO43148 476 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
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CS-216ENST00000549221 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 GOLGA2Q08379 1002 aa10.67□□□□□ -0.7
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CS-216ENST00000549221 DDB1Q16531 1140 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 MRC1P22897 1456 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 EXOC5O00471 708 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 ZNF853P0CG23 659 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
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CS-216ENST00000549221 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 A0A0G2JS52 829 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 MYT1Q01538 1121 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 PDE3BQ13370 1112 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 MIS18AQ9NYP9 233 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-216ENST00000549221 IL16Q14005 1332 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 E9PSI1 815 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 FAM182BQ5T319 152 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 DCAF5Q96JK2 942 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 MBIPQ9NS73 344 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-216ENST00000549221 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
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