RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542167.2

PUS1-208, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PUS1, Length 2,151 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-208ENST00000542167 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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PUS1-208ENST00000542167 ZNF445P59923 1031 aa20.49■□□□□ 0.87
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PUS1-208ENST00000542167 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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PUS1-208ENST00000542167 REC8O95072 547 aa20.3■□□□□ 0.84
PUS1-208ENST00000542167 NME9Q86XW9 330 aa20.3■□□□□ 0.84
PUS1-208ENST00000542167 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PUS1-208ENST00000542167 DCTN1Q14203 1278 aa20.29■□□□□ 0.84
PUS1-208ENST00000542167 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.29■□□□□ 0.84
PUS1-208ENST00000542167 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.29■□□□□ 0.84
PUS1-208ENST00000542167 ITSN1Q15811 1721 aa20.29■□□□□ 0.84
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