RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542019.1

TM7SF3-210, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TM7SF3-210ENST00000542019 NUP188Q5SRE5 1749 aa33.95■■■■□ 3.03
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TM7SF3-210ENST00000542019 PARD3Q8TEW0 1356 aa33.94■■■■□ 3.02
TM7SF3-210ENST00000542019 TATP17735 454 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
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TM7SF3-210ENST00000542019 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa33.9■■■■□ 3.02
TM7SF3-210ENST00000542019 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
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TM7SF3-210ENST00000542019 IGSF1Q8N6C5 1336 aa33.83■■■■□ 3.01
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TM7SF3-210ENST00000542019 SULT6B1Q6IMI4 303 aa33.67■■■□□ 2.98
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TM7SF3-210ENST00000542019 ITGB4P16144 1822 aa33.63■■■□□ 2.97
TM7SF3-210ENST00000542019 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa33.62■■■□□ 2.97
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TM7SF3-210ENST00000542019 LRP5O75197 1615 aa33.61■■■□□ 2.97
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TM7SF3-210ENST00000542019 DCAF5Q96JK2 942 aa33.46■■■□□ 2.95
TM7SF3-210ENST00000542019 C1orf141Q5JVX7 400 aa33.44■■■□□ 2.94
TM7SF3-210ENST00000542019 CFAP53Q96M91 514 aa33.44■■■□□ 2.94
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TM7SF3-210ENST00000542019 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa33.43■■■□□ 2.94
TM7SF3-210ENST00000542019 C5P01031 1676 aa33.42■■■□□ 2.94
TM7SF3-210ENST00000542019 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
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TM7SF3-210ENST00000542019 ZBTB7AO95365 584 aa33.4■■■□□ 2.94
TM7SF3-210ENST00000542019 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
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TM7SF3-210ENST00000542019 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa33.33■■■□□ 2.93
TM7SF3-210ENST00000542019 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
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TM7SF3-210ENST00000542019 PRKAR2BP31323 418 aa33.32■■■□□ 2.92
TM7SF3-210ENST00000542019 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.92
TM7SF3-210ENST00000542019 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa33.32■■■□□ 2.92
TM7SF3-210ENST00000542019 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
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