RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531900.1

GPATCH4-216, Transcript of G-patch domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene GPATCH4, Length 653 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH4-216ENST00000531900 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GPATCH4-216ENST00000531900 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.72□□□□□ -0.05
GPATCH4-216ENST00000531900 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GPATCH4-216ENST00000531900 EYA1Q99502 592 aa14.71□□□□□ -0.05
GPATCH4-216ENST00000531900 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.7□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.7□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.69□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.69□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 RREB1Q92766 1687 aa14.69□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 MTHFSP49914 203 aa14.68□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.68□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.68□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 NHSQ6T4R5 1651 aa14.68□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 IL13P35225 146 aa14.67□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.67□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 KDRP35968 1356 aa14.67□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.66□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 KCNQ2O43526 872 aa14.65□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 TXNRD1Q16881 649 aa14.65□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.65□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 SPON1Q9HCB6 807 aa14.65□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.65□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.65□□□□□ -0.06
GPATCH4-216ENST00000531900 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 PROM2Q8N271 834 aa14.64□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 CYP27B1O15528 508 aa14.63□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 STK32BQ9NY57 414 aa14.63□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 SPG7Q9UQ90 795 aa14.63□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 BTAF1O14981 1849 aa14.62□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 PPP2R1AP30153 589 aa14.6□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.6□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.59□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 SLC15A2Q16348 729 aa14.59□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.59□□□□□ -0.07
GPATCH4-216ENST00000531900 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.58□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.58□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 ITGB4P16144 1822 aa14.57□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 PHKG2P15735 406 aa14.57□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 LY75O60449 1722 aa14.56□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.56□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.56□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 RALBP1Q15311 655 aa14.56□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.56□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 CFAP53Q96M91 514 aa14.56□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 ZBTB7AO95365 584 aa14.55□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.53□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 DCAF5Q96JK2 942 aa14.53□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 MTFR1LQ9H019 292 aa14.53□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GPATCH4-216ENST00000531900 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.52□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 NUDCQ9Y266 331 aa14.52□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 PAPPAQ13219 1627 aa14.52□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 HMOX1P09601 288 aa14.51□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 CASZ1Q86V15 1759 aa14.5□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.5□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.5□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 FCHSD2O94868 740 aa14.5□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.5□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 PIGBQ92521 554 aa14.5□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 PTGER2P43116 358 aa14.49□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 ZNF827Q17R98 1081 aa14.49□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.49□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.49□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.49□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.48□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 AKT1S1Q96B36 256 aa14.48□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.48□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.48□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.47□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.46□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.46□□□□□ -0.09
GPATCH4-216ENST00000531900 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms