RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529728.5

SERGEF-212, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 1,396 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-212ENST00000529728 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
SERGEF-212ENST00000529728 KAT6BQ8WYB5 2073 aa34.29■■■■□ 3.08
SERGEF-212ENST00000529728 APBA3O96018 575 aa34.28■■■■□ 3.08
SERGEF-212ENST00000529728 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
SERGEF-212ENST00000529728 NUP188Q5SRE5 1749 aa34.27■■■■□ 3.08
SERGEF-212ENST00000529728 PTF1AQ7RTS3 328 aa34.26■■■■□ 3.08
SERGEF-212ENST00000529728 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
SERGEF-212ENST00000529728 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa34.26■■■■□ 3.08
SERGEF-212ENST00000529728 BTAF1O14981 1849 aa34.24■■■■□ 3.07
SERGEF-212ENST00000529728 DOT1LQ8TEK3 1739 aa34.24■■■■□ 3.07
SERGEF-212ENST00000529728 IGSF1Q8N6C5 1336 aa34.24■■■■□ 3.07
SERGEF-212ENST00000529728 TATP17735 454 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
SERGEF-212ENST00000529728 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
SERGEF-212ENST00000529728 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa34.23■■■■□ 3.07
SERGEF-212ENST00000529728 PLSCR1O15162 318 aa34.21■■■■□ 3.07
SERGEF-212ENST00000529728 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
SERGEF-212ENST00000529728 KCNQ2O43526 872 aa34.18■■■■□ 3.06
SERGEF-212ENST00000529728 MTHFSP49914 203 aa34.18■■■■□ 3.06
SERGEF-212ENST00000529728 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
SERGEF-212ENST00000529728 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa34.16■■■■□ 3.06
SERGEF-212ENST00000529728 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa34.16■■■■□ 3.06
SERGEF-212ENST00000529728 IL13P35225 146 aa34.15■■■■□ 3.06
SERGEF-212ENST00000529728 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
SERGEF-212ENST00000529728 ACSBG1Q96GR2 724 aa34.14■■■■□ 3.06
SERGEF-212ENST00000529728 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP34.14■■■■□ 3.069e-7■■□□□ 12
SERGEF-212ENST00000529728 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa34.14■■■■□ 3.06
SERGEF-212ENST00000529728 KDRP35968 1356 aa34.13■■■■□ 3.05
SERGEF-212ENST00000529728 CYP27B1O15528 508 aa34.11■■■■□ 3.05
SERGEF-212ENST00000529728 ITGB4P16144 1822 aa34.11■■■■□ 3.05
SERGEF-212ENST00000529728 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.1■■■■□ 3.05
SERGEF-212ENST00000529728 PROM2Q8N271 834 aa34.08■■■■□ 3.05
SERGEF-212ENST00000529728 LY75O60449 1722 aa34.07■■■■□ 3.04
SERGEF-212ENST00000529728 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
SERGEF-212ENST00000529728 SPG7Q9UQ90 795 aa34.06■■■■□ 3.04
SERGEF-212ENST00000529728 AEBP1Q8IUX7 1158 aa34.04■■■■□ 3.04
SERGEF-212ENST00000529728 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
SERGEF-212ENST00000529728 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
SERGEF-212ENST00000529728 PAPPAQ13219 1627 aa34.01■■■■□ 3.04
SERGEF-212ENST00000529728 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
SERGEF-212ENST00000529728 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34■■■■□ 3.03
SERGEF-212ENST00000529728 TXNRD1Q16881 649 aa33.99■■■■□ 3.03
SERGEF-212ENST00000529728 PHKG2P15735 406 aa33.98■■■■□ 3.03
SERGEF-212ENST00000529728 PPP2R1AP30153 589 aa33.98■■■■□ 3.03
SERGEF-212ENST00000529728 IFNL2Q8IZJ0 200 aa33.97■■■■□ 3.03
SERGEF-212ENST00000529728 AMOTQ4VCS5 1084 aa33.95■■■■□ 3.02
SERGEF-212ENST00000529728 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.02
SERGEF-212ENST00000529728 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
SERGEF-212ENST00000529728 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
SERGEF-212ENST00000529728 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
SERGEF-212ENST00000529728 NBPF14Q5TI25 921 aa33.93■■■■□ 3.02
SERGEF-212ENST00000529728 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
SERGEF-212ENST00000529728 LRP5O75197 1615 aa33.91■■■■□ 3.02
SERGEF-212ENST00000529728 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
SERGEF-212ENST00000529728 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
SERGEF-212ENST00000529728 SCN11AQ9UI33 1791 aa33.9■■■■□ 3.02
SERGEF-212ENST00000529728 CASZ1Q86V15 1759 aa33.89■■■■□ 3.02
SERGEF-212ENST00000529728 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 HMOX1P09601 288 aa33.87■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 LRRC4BQ9NT99 713 aa33.87■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 SLC27A3Q5K4L6 730 aa33.86■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 CFAP53Q96M91 514 aa33.86■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 TAF1LQ8IZX4 1826 aa33.86■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 QSER1Q2KHR3 1735 aa33.86■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa33.85■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa33.85■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 PIGBQ92521 554 aa33.84■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 DCAF5Q96JK2 942 aa33.84■■■■□ 3.01
SERGEF-212ENST00000529728 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa33.81■■■■□ 3
SERGEF-212ENST00000529728 C5P01031 1676 aa33.81■■■■□ 3
SERGEF-212ENST00000529728 ERVV-2B6SEH9 535 aa33.8■■■■□ 3
SERGEF-212ENST00000529728 PALLDQ8WX93 1383 aa33.79■■■■□ 3
SERGEF-212ENST00000529728 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
SERGEF-212ENST00000529728 RALBP1Q15311 655 aa33.79■■■■□ 3
SERGEF-212ENST00000529728 SLC15A2Q16348 729 aa33.79■■■■□ 3
SERGEF-212ENST00000529728 C1orf141Q5JVX7 400 aa33.77■■■■□ 3
SERGEF-212ENST00000529728 TMOD3Q9NYL9 352 aa33.77■■■■□ 3
SERGEF-212ENST00000529728 AKAP4Q5JQC9 854 aa33.76■■■■□ 3
SERGEF-212ENST00000529728 STK32BQ9NY57 414 aa33.76■■■■□ 3
SERGEF-212ENST00000529728 ZNF831Q5JPB2 1677 aa33.76■■■□□ 2.99
SERGEF-212ENST00000529728 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
SERGEF-212ENST00000529728 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
SERGEF-212ENST00000529728 NUDCQ9Y266 331 aa33.75■■■□□ 2.99
SERGEF-212ENST00000529728 MRC1P22897 1456 aa33.74■■■□□ 2.99
SERGEF-212ENST00000529728 AKT1S1Q96B36 256 aa33.74■■■□□ 2.99
SERGEF-212ENST00000529728 RSPH6AQ9H0K4 717 aa33.74■■■□□ 2.99
SERGEF-212ENST00000529728 ZNF827Q17R98 1081 aa33.73■■■□□ 2.99
SERGEF-212ENST00000529728 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
SERGEF-212ENST00000529728 KCNQ4P56696 695 aa33.72■■■□□ 2.99
SERGEF-212ENST00000529728 ASAP1Q9ULH1 1129 aa33.7■■■□□ 2.98
SERGEF-212ENST00000529728 ATG3Q9NT62 314 aa33.69■■■□□ 2.98
SERGEF-212ENST00000529728 C4BP0C0L5 1744 aa33.68■■■□□ 2.98
SERGEF-212ENST00000529728 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
SERGEF-212ENST00000529728 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
SERGEF-212ENST00000529728 FCHSD2O94868 740 aa33.66■■■□□ 2.98
SERGEF-212ENST00000529728 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
SERGEF-212ENST00000529728 PRKAR2BP31323 418 aa33.66■■■□□ 2.98
SERGEF-212ENST00000529728 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP33.66■■■□□ 2.98
SERGEF-212ENST00000529728 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
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