RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 TTC22Q5TAA0 569 aa22.35■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 DRC7Q8IY82 874 aa22.35■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 KANK1Q14678 1352 aa22.34■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 CHD1O14646 1710 aa22.34■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 ELF2Q15723 593 aa22.34■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.34■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 SDSP20132 328 aa22.34■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 FIBPO43427 364 aa22.33■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 NEK11Q8NG66 645 aa22.33■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PACS1-205ENST00000527224 MX1P20591 662 aa22.33■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 NOS1P29475 1434 aa22.32■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 GYS2P54840 703 aa22.32■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 SHPRHQ149N8 1683 aa22.31■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.31■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.31■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.31■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.31■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.3■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 CFAP53Q96M91 514 aa22.3■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.29■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 CYP2C19P33261 490 aa22.29■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.29■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 TRIM66O15016 1216 aa22.29■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 SYCP1Q15431 976 aa22.29■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 SOX12O15370 315 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 LUZP1Q86V48 1076 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 PALD1Q9ULE6 856 aa22.28■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 TCHHQ07283 1943 aa22.27■■□□□ 1.16
PACS1-205ENST00000527224 CEP135Q66GS9 1140 aa22.26■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 CASC1Q6TDU7 716 aa22.26■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 USP27XA6NNY8 438 aa22.26■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.25■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 TPM3P06753 285 aa22.25■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.25■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.25■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.25■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 REC8O95072 547 aa22.24■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.24■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.24■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.24■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.24■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.24■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.24■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 CAMK4Q16566 473 aa22.23■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.23■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 TOMM22Q9NS69 142 aa22.23■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 CD109Q6YHK3 1445 aa22.23■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 PRR29P0C7W0 189 aa22.23■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.23■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.22■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.22■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 ERC2O15083 957 aa22.22■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 ABCC11Q96J66 1382 aa22.22■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.21■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 ARID5BQ14865 1188 aa22.21■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.21■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.21■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.2■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 TRIM5Q9C035 493 aa22.2■■□□□ 1.15
PACS1-205ENST00000527224 ERVK-7P63135 1459 aa22.2■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 IQGAP1P46940 1657 aa22.2■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 CUL4AQ13619 759 aa22.2■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 CEP152O94986 1710 aa22.2■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.2■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 UBE2HP62256 183 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 TSPYL6Q8N831 410 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.19■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS1-205ENST00000527224 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.18■■□□□ 1.14
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