RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520166.5

TSNARE1-205, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-205ENST00000520166 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-205ENST00000520166 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-205ENST00000520166 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 GOLGA2Q08379 1002 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 USP21Q9UK80 565 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 SLFN5Q08AF3 891 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 IL17REQ8NFR9 667 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 LGR6Q9HBX8 967 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 AFF2P51816 1311 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 IL2RBP14784 551 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 NGEFQ8N5V2 710 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 CYP27B1O15528 508 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 WDR63Q8IWG1 891 aa22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TSNARE1-205ENST00000520166 MAP3K5Q99683 1374 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 PDE3BQ13370 1112 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 VPS72Q15906 364 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 DISP2A7MBM2 1401 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 SPG7Q9UQ90 795 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 PHKG2P15735 406 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 E9PSI1 815 aa22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF853P0CG23 659 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 MBIPQ9NS73 344 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 IL16Q14005 1332 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 BARGINQ6ZT62 677 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 KRT24Q2M2I5 525 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 CFAP44Q96MT7 982 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 EXOC5O00471 708 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 CHL1O00533 1208 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 IFT57Q9NWB7 429 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 GLI3P10071 1580 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 ATRNO75882 1429 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TSNARE1-205ENST00000520166 KCNQ3O43525 872 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 GNAI1P63096 354 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 LRRC37A3O60309 1634 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 DDB1Q16531 1140 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 TSPYL6Q8N831 410 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 A0A0G2JS52 829 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 MYT1Q01538 1121 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 DCAF5Q96JK2 942 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 FAM182BQ5T319 152 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 TEFQ10587 303 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-205ENST00000520166 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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