RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520057.1

IGHV3-62-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-62 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-62, Length 340 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-62-201ENST00000520057 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-62-201ENST00000520057 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-62-201ENST00000520057 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-62-201ENST00000520057 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-62-201ENST00000520057 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-62-201ENST00000520057 KCNQ2O43526 872 aa22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-62-201ENST00000520057 NBPF14Q5TI25 921 aa22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 PLSCR1O15162 318 aa22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 CFAP53Q96M91 514 aa22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 IL13P35225 146 aa22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-62-201ENST00000520057 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 CYP27B1O15528 508 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 NCAPD2Q15021 1401 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 TXNRD1Q16881 649 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 HMOX1P09601 288 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 NUDCQ9Y266 331 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 PPP2R1AP30153 589 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.14■■□□□ 1.14
IGHV3-62-201ENST00000520057 PHKG2P15735 406 aa22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 SBF2Q86WG5 1849 aa22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 NHSQ6T4R5 1651 aa22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 STK32BQ9NY57 414 aa22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 PROM2Q8N271 834 aa22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 KDRP35968 1356 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 RALBP1Q15311 655 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 DCAF5Q96JK2 942 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-62-201ENST00000520057 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 CABP4P57796 275 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 SLC15A2Q16348 729 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 PIGBQ92521 554 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 NEFMP07197 916 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 RREB1Q92766 1687 aa22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 PALLDQ8WX93 1383 aa22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 BTAF1O14981 1849 aa22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 KCNQ4P56696 695 aa22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 NUP188Q5SRE5 1749 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 PRKAR2BP31323 418 aa22■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 FCHSD2O94868 740 aa21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZNF827Q17R98 1081 aa21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 SPON1Q9HCB6 807 aa21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 MSH5O43196 834 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 ATP6V1AP38606 617 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 SIK1P57059 783 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 ATG3Q9NT62 314 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZBTB7AO95365 584 aa21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 AKT1S1Q96B36 256 aa21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-62-201ENST00000520057 AK7Q96M32 723 aa21.92■■□□□ 1.1
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