RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 CRB1P82279 1406 aa22.31■■□□□ 1.16
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TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-204ENST00000519651 NBPF4Q96M43 638 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-204ENST00000519651 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.31■■□□□ 1.16
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TSNARE1-204ENST00000519651 G2E3Q7L622 706 aa22.09■■□□□ 1.13
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TSNARE1-204ENST00000519651 RGS12O14924 1447 aa22.06■■□□□ 1.12
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TSNARE1-204ENST00000519651 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-204ENST00000519651 FLIIQ13045 1269 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-204ENST00000519651 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-204ENST00000519651 GCC1Q96CN9 775 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-204ENST00000519651 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-204ENST00000519651 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-204ENST00000519651 NUCB1Q02818 461 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-204ENST00000519651 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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