RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 CRB1P82279 1406 aa20.29■□□□□ 0.84
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TRPS1-206ENST00000517323 LGR6Q9HBX8 967 aa20.28■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 PDE3BQ13370 1112 aa20.28■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.28■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 EP400Q96L91 3159 aa20.28■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.27■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRPS1-206ENST00000517323 SLIT2O94813 1529 aa20.27■□□□□ 0.83
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TRPS1-206ENST00000517323 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.25■□□□□ 0.83
TRPS1-206ENST00000517323 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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TRPS1-206ENST00000517323 E9PSI1 815 aa20.25■□□□□ 0.83
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TRPS1-206ENST00000517323 NGEFQ8N5V2 710 aa20.23■□□□□ 0.83
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TRPS1-206ENST00000517323 KRT24Q2M2I5 525 aa20.22■□□□□ 0.83
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TRPS1-206ENST00000517323 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.22■□□□□ 0.83
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TRPS1-206ENST00000517323 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.21■□□□□ 0.83
TRPS1-206ENST00000517323 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.21■□□□□ 0.83
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TRPS1-206ENST00000517323 USP21Q9UK80 565 aa20.21■□□□□ 0.83
TRPS1-206ENST00000517323 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.21■□□□□ 0.83
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TRPS1-206ENST00000517323 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.19■□□□□ 0.82
TRPS1-206ENST00000517323 PHKG2P15735 406 aa20.19■□□□□ 0.82
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TRPS1-206ENST00000517323 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.18■□□□□ 0.82
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TRPS1-206ENST00000517323 ZNF853P0CG23 659 aa20.17■□□□□ 0.82
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TRPS1-206ENST00000517323 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.15■□□□□ 0.82
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TRPS1-206ENST00000517323 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.14■□□□□ 0.82
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TRPS1-206ENST00000517323 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.14■□□□□ 0.81
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TRPS1-206ENST00000517323 SLC39A6Q13433 755 aa20.11■□□□□ 0.81
TRPS1-206ENST00000517323 FAM182BQ5T319 152 aa20.11■□□□□ 0.81
TRPS1-206ENST00000517323 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TRPS1-206ENST00000517323 GLI3P10071 1580 aa20.1■□□□□ 0.81
TRPS1-206ENST00000517323 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TRPS1-206ENST00000517323 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.09■□□□□ 0.81
TRPS1-206ENST00000517323 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRPS1-206ENST00000517323 EXOC5O00471 708 aa20.08■□□□□ 0.81
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