RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.69□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 ERBB3P21860 1342 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNQ2O43526 872 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 EYA1Q99502 592 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.68□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 SPG7Q9UQ90 795 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.67□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 IFT172Q9UG01 1749 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 SEMA3EO15041 775 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 MRS2Q9HD23 443 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 NPHP1O15259 732 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 NBPF14Q5TI25 921 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 STK24Q9Y6E0 443 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 SSH2Q76I76 1423 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 CABP4P57796 275 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 TEFQ10587 303 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RRN3P1-201ENST00000514813 USP19O94966 1318 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 FLT4P35916 1363 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 PHF14O94880 888 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 TMOD3Q9NYL9 352 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 PRKAR2BP31323 418 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.64□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 NGEFQ8N5V2 710 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP2R1AP30153 589 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 CRB1P82279 1406 aa8.63□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 IFNL2Q8IZJ0 200 aa8.62□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.62□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 RGS12O14924 1447 aa8.62□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 DCTN1Q14203 1278 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 ZBTB7AO95365 584 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 BARGINQ6ZT62 677 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC39A6Q13433 755 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 STK32BQ9NY57 414 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 MIS18AQ9NYP9 233 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 KIF1AQ12756 1690 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF428Q96B54 188 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 CPDO75976 1380 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 SMIM5Q71RC9 77 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP6V1AP38606 617 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 MSL1Q68DK7 614 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 EP400Q96L91 3159 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 USP32Q8NFA0 1604 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3P1-201ENST00000514813 TXNRD1Q16881 649 aa8.59□□□□□ -1.04
RRN3P1-201ENST00000514813 MCM10Q7L590 875 aa8.59□□□□□ -1.04
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3P1-201ENST00000514813 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RRN3P1-201ENST00000514813 IGSF3O75054 1194 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3P1-201ENST00000514813 AK7Q96M32 723 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3P1-201ENST00000514813 ATRNO75882 1429 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3P1-201ENST00000514813 SLIT2O94813 1529 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3P1-201ENST00000514813 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms