RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511347.5

SPATA20-217, Transcript of spermatogenesis associated 20, humanhuman

TSL 5

Gene SPATA20, Length 1,035 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20-217ENST00000511347 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.79■■□□□ 1.08
SPATA20-217ENST00000511347 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.77■■□□□ 1.08
SPATA20-217ENST00000511347 NCAPD2Q15021 1401 aa21.77■■□□□ 1.08
SPATA20-217ENST00000511347 KCNQ2O43526 872 aa21.76■■□□□ 1.07
SPATA20-217ENST00000511347 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SPATA20-217ENST00000511347 IL13P35225 146 aa21.74■■□□□ 1.07
SPATA20-217ENST00000511347 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.74■■□□□ 1.07
SPATA20-217ENST00000511347 PLSCR1O15162 318 aa21.72■■□□□ 1.07
SPATA20-217ENST00000511347 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.72■■□□□ 1.07
SPATA20-217ENST00000511347 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.71■■□□□ 1.07
SPATA20-217ENST00000511347 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.71■■□□□ 1.07
SPATA20-217ENST00000511347 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.71■■□□□ 1.07
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SPATA20-217ENST00000511347 SBF2Q86WG5 1849 aa21.7■■□□□ 1.06
SPATA20-217ENST00000511347 CYP27B1O15528 508 aa21.69■■□□□ 1.06
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SPATA20-217ENST00000511347 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.67■■□□□ 1.06
SPATA20-217ENST00000511347 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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SPATA20-217ENST00000511347 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.65■■□□□ 1.06
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SPATA20-217ENST00000511347 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.63■■□□□ 1.05
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SPATA20-217ENST00000511347 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SPATA20-217ENST00000511347 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.63■■□□□ 1.05
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SPATA20-217ENST00000511347 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.6■■□□□ 1.05
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SPATA20-217ENST00000511347 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.57■■□□□ 1.04
SPATA20-217ENST00000511347 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SPATA20-217ENST00000511347 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.56■■□□□ 1.04
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SPATA20-217ENST00000511347 NUDCQ9Y266 331 aa21.54■■□□□ 1.04
SPATA20-217ENST00000511347 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.54■■□□□ 1.04
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SPATA20-217ENST00000511347 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.52■■□□□ 1.04
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SPATA20-217ENST00000511347 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.5■■□□□ 1.03
SPATA20-217ENST00000511347 KCNQ4P56696 695 aa21.5■■□□□ 1.03
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SPATA20-217ENST00000511347 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
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SPATA20-217ENST00000511347 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SPATA20-217ENST00000511347 LRP5O75197 1615 aa21.48■■□□□ 1.03
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SPATA20-217ENST00000511347 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.48■■□□□ 1.03
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SPATA20-217ENST00000511347 FCHSD2O94868 740 aa21.44■■□□□ 1.02
SPATA20-217ENST00000511347 ZNF827Q17R98 1081 aa21.44■■□□□ 1.02
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SPATA20-217ENST00000511347 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.43■■□□□ 1.02
SPATA20-217ENST00000511347 AKT1S1Q96B36 256 aa21.43■■□□□ 1.02
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SPATA20-217ENST00000511347 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SPATA20-217ENST00000511347 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SPATA20-217ENST00000511347 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.4■■□□□ 1.02
SPATA20-217ENST00000511347 SIK1P57059 783 aa21.4■■□□□ 1.02
SPATA20-217ENST00000511347 LY75O60449 1722 aa21.4■■□□□ 1.02
SPATA20-217ENST00000511347 PAPPAQ13219 1627 aa21.4■■□□□ 1.02
SPATA20-217ENST00000511347 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.38■■□□□ 1.01
SPATA20-217ENST00000511347 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SPATA20-217ENST00000511347 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.38■■□□□ 1.01
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