RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508179.1

SNHG18-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG18, Length 1,799 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG18-201ENST00000508179 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SNHG18-201ENST00000508179 PPP2R1AP30153 589 aa22.21■■□□□ 1.15
SNHG18-201ENST00000508179 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.21■■□□□ 1.15
SNHG18-201ENST00000508179 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG18-201ENST00000508179 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SNHG18-201ENST00000508179 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SNHG18-201ENST00000508179 BCL9O00512 1426 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG18-201ENST00000508179 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG18-201ENST00000508179 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG18-201ENST00000508179 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG18-201ENST00000508179 CFAP53Q96M91 514 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG18-201ENST00000508179 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.14■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.14■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 BAG6P46379 1132 aa22.14■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.14■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 NHSQ6T4R5 1651 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 RALBP1Q15311 655 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 KDRP35968 1356 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 APBA3O96018 575 aa22.12■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.12■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 SPG7Q9UQ90 795 aa22.12■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 HMOX1P09601 288 aa22.12■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 CYP27B1O15528 508 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 KCNQ2O43526 872 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 BTAF1O14981 1849 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG18-201ENST00000508179 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 NUDCQ9Y266 331 aa22.07■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 ITGB4P16144 1822 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.05■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.05■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 PHKG2P15735 406 aa22.04■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.04■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.04■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 RREB1Q92766 1687 aa22.02■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SNHG18-201ENST00000508179 PLSCR1O15162 318 aa22.02■■□□□ 1.11
SNHG18-201ENST00000508179 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
SNHG18-201ENST00000508179 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
SNHG18-201ENST00000508179 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG18-201ENST00000508179 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG18-201ENST00000508179 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG18-201ENST00000508179 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG18-201ENST00000508179 PRKAR2BP31323 418 aa21.97■■□□□ 1.11
SNHG18-201ENST00000508179 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SNHG18-201ENST00000508179 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG18-201ENST00000508179 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SNHG18-201ENST00000508179 FCHSD2O94868 740 aa21.95■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 DCAF5Q96JK2 942 aa21.95■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.94■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 PROM2Q8N271 834 aa21.94■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 LY75O60449 1722 aa21.94■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 TXNRD1Q16881 649 aa21.94■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.94■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 ANP32CO43423 234 aa21.92■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 PIGBQ92521 554 aa21.92■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.92■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.91■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.9■■□□□ 1.1
SNHG18-201ENST00000508179 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.89■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 CABP4P57796 275 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 LGR6Q9HBX8 967 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.88■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 PALLDQ8WX93 1383 aa21.87■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 MAP3K5Q99683 1374 aa21.87■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 NEFMP07197 916 aa21.87■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 NBPF14Q5TI25 921 aa21.87■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.87■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 KCNQ4P56696 695 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.86■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.85■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.84■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.83■■□□□ 1.09
SNHG18-201ENST00000508179 PAPPAQ13219 1627 aa21.83■■□□□ 1.09
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