RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507538.1

RASGEF1B-205, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 691 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-205ENST00000507538 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.21■■□□□ 1.47
RASGEF1B-205ENST00000507538 TRIM37O94972 964 aa24.21■■□□□ 1.47
RASGEF1B-205ENST00000507538 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.21■■□□□ 1.47
RASGEF1B-205ENST00000507538 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RASGEF1B-205ENST00000507538 KDRP35968 1356 aa24.2■■□□□ 1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.2■■□□□ 1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.2■■□□□ 1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.19■■□□□ 1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.19■■□□□ 1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 SPG7Q9UQ90 795 aa24.17■■□□□ 1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
RASGEF1B-205ENST00000507538 CYP27B1O15528 508 aa24.14■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 HMOX1P09601 288 aa24.14■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 BAG6P46379 1132 aa24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.12■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 NUDCQ9Y266 331 aa24.12■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.11■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 APBA3O96018 575 aa24.1■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.1■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 KCNQ2O43526 872 aa24.09■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 PHKG2P15735 406 aa24.08■■□□□ 1.45
RASGEF1B-205ENST00000507538 NHSQ6T4R5 1651 aa24.08■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.07■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 SBF2Q86WG5 1849 aa24.06■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.04■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.03■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.02■■□□□ 1.44
RASGEF1B-205ENST00000507538 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRKAR2BP31323 418 aa24.01■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLSCR1O15162 318 aa24■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 FCHSD2O94868 740 aa24■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 ANP32CO43423 234 aa23.99■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 DCAF5Q96JK2 942 aa23.99■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.98■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.97■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.96■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.96■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.96■■□□□ 1.43
RASGEF1B-205ENST00000507538 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.95■■□□□ 1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 BTAF1O14981 1849 aa23.95■■□□□ 1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.94■■□□□ 1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.93■■□□□ 1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 PIGBQ92521 554 aa23.93■■□□□ 1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 TXNRD1Q16881 649 aa23.92■■□□□ 1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 PROM2Q8N271 834 aa23.92■■□□□ 1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 RREB1Q92766 1687 aa23.92■■□□□ 1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 MAP3K5Q99683 1374 aa23.91■■□□□ 1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.9■■□□□ 1.42
RASGEF1B-205ENST00000507538 NEFMP07197 916 aa23.89■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 CABP4P57796 275 aa23.89■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.88■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 LGR6Q9HBX8 967 aa23.88■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 PALLDQ8WX93 1383 aa23.88■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.87■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 CCDC184Q52MB2 194 aa23.86■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 MRC1P22897 1456 aa23.86■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.85■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 ITGB4P16144 1822 aa23.85■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.85■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.85■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.85■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.84■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.84■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.84■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.84■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 NBPF14Q5TI25 921 aa23.83■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 ATG3Q9NT62 314 aa23.83■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.83■■□□□ 1.41
RASGEF1B-205ENST00000507538 IL17REQ8NFR9 667 aa23.82■■□□□ 1.4
RASGEF1B-205ENST00000507538 MRS2Q9HD23 443 aa23.82■■□□□ 1.4
RASGEF1B-205ENST00000507538 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.81■■□□□ 1.4
RASGEF1B-205ENST00000507538 NFE2L2Q16236 605 aa23.81■■□□□ 1.4
RASGEF1B-205ENST00000507538 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms