RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489639.1

MFSD1-217, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-217ENST00000489639 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.41□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 SOX12O15370 315 aa8.41□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 FKBP8Q14318 412 aa8.41□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 COG3Q96JB2 828 aa8.41□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 SSH2Q76I76 1423 aa8.4□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 NUTM2FA1L443 756 aa8.4□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 MTHFSP49914 203 aa8.4□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 NME9Q86XW9 330 aa8.4□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.4□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 TMEM94Q12767 1356 aa8.39□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.39□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 NGEFQ8N5V2 710 aa8.39□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 STRCQ7RTU9 1775 aa8.39□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 USP31Q70CQ4 1352 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 ATF3P18847 181 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 NUDCQ9Y266 331 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 MSH6P52701 1360 aa8.37□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.37□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 PDE3BQ13370 1112 aa8.37□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.37□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.37□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 KCNK17Q96T54 332 aa8.37□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.37□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 KIF1AQ12756 1690 aa8.37□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 POLKQ9UBT6 870 aa8.36□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 SHPRHQ149N8 1683 aa8.36□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 MST1RQ04912 1400 aa8.36□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.35□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 USP54Q70EL1 1684 aa8.35□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 PSME1Q06323 249 aa8.34□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 RUNDC1Q96C34 613 aa8.34□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.34□□□□□ -1.07
MFSD1-217ENST00000489639 PIK3C2AO00443 1686 aa8.34□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 NLRP6P59044 892 aa8.33□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.33□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 ABTB2Q8N961 1025 aa8.32□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 ORAI2Q96SN7 254 aa8.32□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.32□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 SBNO1A3KN83 1393 aa8.32□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.32□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.31□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 APAF1O14727 1248 aa8.31□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 FCHSD2O94868 740 aa8.31□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 HSPA1LP34931 641 aa8.31□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.31□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.31□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 KCNH5Q8NCM2 988 aa8.31□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 RTL1A6NKG5 1358 aa8.31□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 FLT4P35916 1363 aa8.31□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF521Q96K83 1311 aa8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 FOXO3O43524 673 aa8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 GFRA3O60609 400 aa8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 NEFLP07196 543 aa8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 NEFMP07197 916 aa8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 IL13P35225 146 aa8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 WNT2BQ93097 391 aa8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 FBXO3Q9UK99 471 aa8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.3□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 USP19O94966 1318 aa8.29□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.29□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 AMPHP49418 695 aa8.29□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 CCDC27Q2M243 656 aa8.29□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.29□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 SLIT3O75094 1523 aa8.29□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 NFAT5O94916 1531 aa8.29□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 ARHGEF10O15013 1369 aa8.28□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 FBLN1P23142 703 aa8.28□□□□□ -1.08
MFSD1-217ENST00000489639 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms