RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488488.1

TMOD4-205, Transcript of tropomodulin 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD4, Length 613 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4-205ENST00000488488 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 LTN1O94822 1766 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 STRCQ7RTU9 1775 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 TSPYL6Q8N831 410 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 MAP3K5Q99683 1374 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 PXDNQ92626 1479 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 ABCC6O95255 1503 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 C8orf58Q8NAV2 365 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 ABCC4O15439 1325 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 NBPF4Q96M43 638 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 LMO7Q8WWI1 1683 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 MSH5O43196 834 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 IGHDP01880 384 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 TSPYL4Q9UJ04 414 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 BRINP3Q76B58 766 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD4-205ENST00000488488 CPDO75976 1380 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 PTPRCP08575 1304 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 ERBB3P21860 1342 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 PDE4AP27815 886 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 RGS12O14924 1447 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 KRT24Q2M2I5 525 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 AKAP4Q5JQC9 854 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 SKAP1Q86WV1 359 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 IL17REQ8NFR9 667 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 BACH2Q9BYV9 841 aa8.63□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 COL18A1P39060 1754 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 FAM161AQ3B820 660 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 MIS18AQ9NYP9 233 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 SLAIN2Q9P270 581 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 RNMTO43148 476 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 PLEKHG5O94827 1062 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 HOXB7P09629 217 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 RGS3P49796 1198 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 C1orf141Q5JVX7 400 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 SMC5Q8IY18 1101 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 C8orf34Q49A92 452 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 CCDC30Q5VVM6 783 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 STK31Q9BXU1 1019 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
TMOD4-205ENST00000488488 SLC4A2P04920 1241 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD4-205ENST00000488488 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD4-205ENST00000488488 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD4-205ENST00000488488 TEFQ10587 303 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD4-205ENST00000488488 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD4-205ENST00000488488 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD4-205ENST00000488488 LGR6Q9HBX8 967 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD4-205ENST00000488488 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD4-205ENST00000488488 MEGF6O75095 1541 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD4-205ENST00000488488 KDM3BQ7LBC6 1761 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD4-205ENST00000488488 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD4-205ENST00000488488 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms