RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 PPP2R1AP30153 589 aa16.43■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.43■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 ACSBG1Q96GR2 724 aa16.43■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 KCNQ2O43526 872 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 APBA3O96018 575 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
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NISCH-210ENST00000488157 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.2
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NISCH-210ENST00000488157 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-210ENST00000488157 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-210ENST00000488157 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
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NISCH-210ENST00000488157 LGR6Q9HBX8 967 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-210ENST00000488157 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
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NISCH-210ENST00000488157 DCAF5Q96JK2 942 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-210ENST00000488157 LY75O60449 1722 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-210ENST00000488157 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-210ENST00000488157 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-210ENST00000488157 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-210ENST00000488157 FCHSD2O94868 740 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-210ENST00000488157 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
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NISCH-210ENST00000488157 ERVV-2B6SEH9 535 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-210ENST00000488157 RNMTO43148 476 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
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NISCH-210ENST00000488157 NBPF14Q5TI25 921 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-210ENST00000488157 IL17REQ8NFR9 667 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-210ENST00000488157 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.17■□□□□ 0.18
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NISCH-210ENST00000488157 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-210ENST00000488157 ZNF827Q17R98 1081 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-210ENST00000488157 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-210ENST00000488157 MAP3K5Q99683 1374 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-210ENST00000488157 GNAT3A8MTJ3 354 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-210ENST00000488157 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-210ENST00000488157 SLC15A2Q16348 729 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-210ENST00000488157 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NISCH-210ENST00000488157 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.14■□□□□ 0.17
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