RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 IL13P35225 146 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRN-216ENST00000486480 NHSQ6T4R5 1651 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRN-216ENST00000486480 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRN-216ENST00000486480 TRIM37O94972 964 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRN-216ENST00000486480 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PTPRN-216ENST00000486480 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 KDRP35968 1356 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 CFAP53Q96M91 514 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 RALBP1Q15311 655 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRN-216ENST00000486480 BAG6P46379 1132 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 BTAF1O14981 1849 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 SPG7Q9UQ90 795 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 CYP27B1O15528 508 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 RREB1Q92766 1687 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 APBA3O96018 575 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 HMOX1P09601 288 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 ITGB4P16144 1822 aa25.7■■□□□ 1.71
PTPRN-216ENST00000486480 KCNQ2O43526 872 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 NUDCQ9Y266 331 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 PHKG2P15735 406 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
PTPRN-216ENST00000486480 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PTPRN-216ENST00000486480 PLSCR1O15162 318 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRN-216ENST00000486480 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRN-216ENST00000486480 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PTPRN-216ENST00000486480 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
PTPRN-216ENST00000486480 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRN-216ENST00000486480 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRN-216ENST00000486480 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRN-216ENST00000486480 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRN-216ENST00000486480 LY75O60449 1722 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRN-216ENST00000486480 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PTPRN-216ENST00000486480 PRKAR2BP31323 418 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRN-216ENST00000486480 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRN-216ENST00000486480 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRN-216ENST00000486480 DCAF5Q96JK2 942 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRN-216ENST00000486480 FCHSD2O94868 740 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRN-216ENST00000486480 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRN-216ENST00000486480 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRN-216ENST00000486480 TXNRD1Q16881 649 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRN-216ENST00000486480 PROM2Q8N271 834 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRN-216ENST00000486480 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRN-216ENST00000486480 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRN-216ENST00000486480 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRN-216ENST00000486480 PAPPAQ13219 1627 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRN-216ENST00000486480 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRN-216ENST00000486480 MRC1P22897 1456 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRN-216ENST00000486480 PIGBQ92521 554 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRN-216ENST00000486480 MAP3K5Q99683 1374 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRN-216ENST00000486480 ANP32CO43423 234 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRN-216ENST00000486480 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRN-216ENST00000486480 PALLDQ8WX93 1383 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRN-216ENST00000486480 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 C5P01031 1676 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 CABP4P57796 275 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 LGR6Q9HBX8 967 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 NEFMP07197 916 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 NBPF14Q5TI25 921 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.4■■□□□ 1.66
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