RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484130.1

RPL13AP25-201, Transcript of ribosomal protein L13a pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RPL13AP25, Length 612 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP25-201ENST00000484130 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.86■□□□□ 0.93
RPL13AP25-201ENST00000484130 PPP2R1AP30153 589 aa20.86■□□□□ 0.93
RPL13AP25-201ENST00000484130 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.85■□□□□ 0.93
RPL13AP25-201ENST00000484130 IL13P35225 146 aa20.85■□□□□ 0.93
RPL13AP25-201ENST00000484130 BAG6P46379 1132 aa20.85■□□□□ 0.93
RPL13AP25-201ENST00000484130 MEGF6O75095 1541 aa20.84■□□□□ 0.93
RPL13AP25-201ENST00000484130 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
RPL13AP25-201ENST00000484130 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.83■□□□□ 0.93
RPL13AP25-201ENST00000484130 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.81■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 FAM182BQ5T319 152 aa20.81■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 KDRP35968 1356 aa20.81■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 TRIM37O94972 964 aa20.8■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.8■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.78■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.77■□□□□ 0.92
RPL13AP25-201ENST00000484130 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 NEFMP07197 916 aa20.76■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 APBA3O96018 575 aa20.75■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.75■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 SBF2Q86WG5 1849 aa20.74■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 ANP32CO43423 234 aa20.73■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 NHSQ6T4R5 1651 aa20.72■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.72■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 PLSCR1O15162 318 aa20.71■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 HMOX1P09601 288 aa20.71■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.71■□□□□ 0.91
RPL13AP25-201ENST00000484130 CYP27B1O15528 508 aa20.7■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 FCHSD2O94868 740 aa20.7■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 PHKG2P15735 406 aa20.7■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.7■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.69■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 DCAF5Q96JK2 942 aa20.69■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.69■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.67■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.67■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.65■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.65■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.65■□□□□ 0.9
RPL13AP25-201ENST00000484130 KCNQ2O43526 872 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 PRKAR2BP31323 418 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 NBPF14Q5TI25 921 aa20.63■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 BTAF1O14981 1849 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 CABP4P57796 275 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.58■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RPL13AP25-201ENST00000484130 MAP3K5Q99683 1374 aa20.58■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 TXNRD1Q16881 649 aa20.57■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 ITGB4P16144 1822 aa20.56■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 RREB1Q92766 1687 aa20.56■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.55■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 PIGBQ92521 554 aa20.55■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.54■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 PALLDQ8WX93 1383 aa20.54■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.54■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.53■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.52■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 TEFQ10587 303 aa20.52■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.52■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 STK32BQ9NY57 414 aa20.52■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RPL13AP25-201ENST00000484130 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.5■□□□□ 0.87
RPL13AP25-201ENST00000484130 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.5■□□□□ 0.87
RPL13AP25-201ENST00000484130 MRS2Q9HD23 443 aa20.5■□□□□ 0.87
RPL13AP25-201ENST00000484130 MRC1P22897 1456 aa20.5■□□□□ 0.87
RPL13AP25-201ENST00000484130 NFE2L2Q16236 605 aa20.49■□□□□ 0.87
RPL13AP25-201ENST00000484130 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.49■□□□□ 0.87
RPL13AP25-201ENST00000484130 RUNDC1Q96C34 613 aa20.49■□□□□ 0.87
RPL13AP25-201ENST00000484130 LY75O60449 1722 aa20.49■□□□□ 0.87
RPL13AP25-201ENST00000484130 PROM2Q8N271 834 aa20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP25-201ENST00000484130 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 167.3 ms