RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483639.1

UBE2Q1-205, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-205ENST00000483639 SYT17Q9BSW7 474 aa15.9■□□□□ 0.14
UBE2Q1-205ENST00000483639 NSD2O96028 1365 aa15.89■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.89■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.88■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 BTAF1O14981 1849 aa15.88■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 ARXQ96QS3 562 aa15.87■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.87■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.87■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 CDCA8Q53HL2 280 aa15.86■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.85■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 INSRP06213 1382 aa15.85■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.84■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.84■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 CGNL1Q0VF96 1302 aa15.84■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 FLT4P35916 1363 aa15.84■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.84■□□□□ 0.13
UBE2Q1-205ENST00000483639 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.82■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 MAP3K5Q99683 1374 aa15.82■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.81■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.8■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.8■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.8■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.8■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 CYP27B1O15528 508 aa15.8■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 POLD1P28340 1107 aa15.79■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 KLHL34Q8N239 644 aa15.79■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.79■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.79■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 UTRNP46939 3433 aa15.78■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.77■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
UBE2Q1-205ENST00000483639 PALLDQ8WX93 1383 aa15.76■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 MSH5O43196 834 aa15.76■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.76■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.75■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 GPR162Q16538 588 aa15.75■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.75■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.75■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 NCAPD2Q15021 1401 aa15.75■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.74■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 MSL1Q68DK7 614 aa15.74■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 EYA1Q99502 592 aa15.74■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 POLKQ9UBT6 870 aa15.74■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 LY75O60449 1722 aa15.74■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.73■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 PIGBQ92521 554 aa15.73■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.71■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 AMIGO3Q86WK7 504 aa15.71■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 SPG7Q9UQ90 795 aa15.71■□□□□ 0.11
UBE2Q1-205ENST00000483639 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.71■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 SMIM5Q71RC9 77 aa15.7■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.13e-8■■■■□ 26.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 AK7Q96M32 723 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 27.2
UBE2Q1-205ENST00000483639 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.68■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 PHF14O94880 888 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 PHKG2P15735 406 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.67■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 FLAD1Q8NFF5 587 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.67■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 SIK1P57059 783 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 IFNL2Q8IZJ0 200 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 PANK3Q9H999 370 aa15.66■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 C5P01031 1676 aa15.65■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 ITPK1Q13572 414 aa15.65■□□□□ 0.1
UBE2Q1-205ENST00000483639 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.64■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 ATG3Q9NT62 314 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 CD2APQ9Y5K6 639 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 C4BP0C0L5 1744 aa15.63■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 GRIN3BO60391 1043 aa15.62■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 SSFA2P28290 1259 aa15.62■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 ATP6V1AP38606 617 aa15.62■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 GNPATO15228 680 aa15.61■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 C1QTNF8P60827 252 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa15.6■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 MORC1Q86VD1 984 aa15.59■□□□□ 0.09
UBE2Q1-205ENST00000483639 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms