RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483521.1

PKN3-202, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

TSL 5

Gene PKN3, Length 597 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-202ENST00000483521 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PKN3-202ENST00000483521 MEGF6O75095 1541 aa24.86■■□□□ 1.57
PKN3-202ENST00000483521 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.86■■□□□ 1.57
PKN3-202ENST00000483521 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PKN3-202ENST00000483521 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PKN3-202ENST00000483521 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PKN3-202ENST00000483521 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.85■■□□□ 1.57
PKN3-202ENST00000483521 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PKN3-202ENST00000483521 NHSQ6T4R5 1651 aa24.83■■□□□ 1.57
PKN3-202ENST00000483521 PLSCR1O15162 318 aa24.83■■□□□ 1.57
PKN3-202ENST00000483521 RREB1Q92766 1687 aa24.82■■□□□ 1.56
PKN3-202ENST00000483521 NCAPD2Q15021 1401 aa24.82■■□□□ 1.56
PKN3-202ENST00000483521 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PKN3-202ENST00000483521 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.79■■□□□ 1.56
PKN3-202ENST00000483521 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.79■■□□□ 1.56
PKN3-202ENST00000483521 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.79■■□□□ 1.56
PKN3-202ENST00000483521 NBPF14Q5TI25 921 aa24.78■■□□□ 1.56
PKN3-202ENST00000483521 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.78■■□□□ 1.56
PKN3-202ENST00000483521 EYA1Q99502 592 aa24.78■■□□□ 1.56
PKN3-202ENST00000483521 KCNQ2O43526 872 aa24.77■■□□□ 1.56
PKN3-202ENST00000483521 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.77■■□□□ 1.56
PKN3-202ENST00000483521 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.77■■□□□ 1.56
PKN3-202ENST00000483521 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.76■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.76■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.73■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.73■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 SPG7Q9UQ90 795 aa24.73■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.72■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 BTAF1O14981 1849 aa24.71■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PKN3-202ENST00000483521 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.7■■□□□ 1.54
PKN3-202ENST00000483521 TXNRD1Q16881 649 aa24.7■■□□□ 1.54
PKN3-202ENST00000483521 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PKN3-202ENST00000483521 MTHFSP49914 203 aa24.68■■□□□ 1.54
PKN3-202ENST00000483521 CYP27B1O15528 508 aa24.67■■□□□ 1.54
PKN3-202ENST00000483521 PROM2Q8N271 834 aa24.67■■□□□ 1.54
PKN3-202ENST00000483521 IL13P35225 146 aa24.64■■□□□ 1.54
PKN3-202ENST00000483521 MRS2Q9HD23 443 aa24.64■■□□□ 1.54
PKN3-202ENST00000483521 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.62■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.62■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 KDRP35968 1356 aa24.62■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.61■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 STK32BQ9NY57 414 aa24.61■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 LRP5O75197 1615 aa24.61■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.6■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 PHKG2P15735 406 aa24.59■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.58■■□□□ 1.53
PKN3-202ENST00000483521 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 SLC15A2Q16348 729 aa24.56■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.56■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 CFAP53Q96M91 514 aa24.56■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.55■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 PAPPAQ13219 1627 aa24.54■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 LY75O60449 1722 aa24.54■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 PPP2R1AP30153 589 aa24.53■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.53■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 DCAF5Q96JK2 942 aa24.53■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.53■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.53■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 ITGB4P16144 1822 aa24.52■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 PALLDQ8WX93 1383 aa24.52■■□□□ 1.52
PKN3-202ENST00000483521 HMOX1P09601 288 aa24.5■■□□□ 1.51
PKN3-202ENST00000483521 PIGBQ92521 554 aa24.5■■□□□ 1.51
PKN3-202ENST00000483521 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.49■■□□□ 1.51
PKN3-202ENST00000483521 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PKN3-202ENST00000483521 SPON1Q9HCB6 807 aa24.48■■□□□ 1.51
PKN3-202ENST00000483521 CASZ1Q86V15 1759 aa24.47■■□□□ 1.51
PKN3-202ENST00000483521 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PKN3-202ENST00000483521 NUDCQ9Y266 331 aa24.47■■□□□ 1.51
PKN3-202ENST00000483521 ZNF827Q17R98 1081 aa24.46■■□□□ 1.51
PKN3-202ENST00000483521 CCDC184Q52MB2 194 aa24.45■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 AKT1S1Q96B36 256 aa24.45■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 KCNQ4P56696 695 aa24.44■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.44■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 CABP4P57796 275 aa24.43■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.43■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.41■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 C5P01031 1676 aa24.41■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.41■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 MTFR1LQ9H019 292 aa24.4■■□□□ 1.5
PKN3-202ENST00000483521 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms