RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 ZBTB7AO95365 584 aa25.74■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 INSRP06213 1382 aa25.73■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 FLT4P35916 1363 aa25.73■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.72■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CLK1-211ENST00000481641 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CLK1-211ENST00000481641 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.7■■□□□ 1.7
CLK1-211ENST00000481641 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.69■■□□□ 1.7
CLK1-211ENST00000481641 PAPPAQ13219 1627 aa25.68■■□□□ 1.7
CLK1-211ENST00000481641 ZNF827Q17R98 1081 aa25.68■■□□□ 1.7
CLK1-211ENST00000481641 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.67■■□□□ 1.7
CLK1-211ENST00000481641 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CLK1-211ENST00000481641 KCNQ4P56696 695 aa25.67■■□□□ 1.7
CLK1-211ENST00000481641 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.67■■□□□ 1.7
CLK1-211ENST00000481641 NSD2O96028 1365 aa25.66■■□□□ 1.7
CLK1-211ENST00000481641 PTGER2P43116 358 aa25.65■■□□□ 1.7
CLK1-211ENST00000481641 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CLK1-211ENST00000481641 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CLK1-211ENST00000481641 PANK3Q9H999 370 aa25.62■■□□□ 1.69
CLK1-211ENST00000481641 POLKQ9UBT6 870 aa25.62■■□□□ 1.69
CLK1-211ENST00000481641 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.61■■□□□ 1.69
CLK1-211ENST00000481641 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.6■■□□□ 1.69
CLK1-211ENST00000481641 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.6■■□□□ 1.69
CLK1-211ENST00000481641 AKT1S1Q96B36 256 aa25.6■■□□□ 1.69
CLK1-211ENST00000481641 CYP27B1O15528 508 aa25.59■■□□□ 1.69
CLK1-211ENST00000481641 MTFR1LQ9H019 292 aa25.59■■□□□ 1.69
CLK1-211ENST00000481641 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.59■■□□□ 1.69
CLK1-211ENST00000481641 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.59■■□□□ 1.69
CLK1-211ENST00000481641 EYA1Q99502 592 aa25.58■■□□□ 1.69
CLK1-211ENST00000481641 LY75O60449 1722 aa25.57■■□□□ 1.68
CLK1-211ENST00000481641 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.56■■□□□ 1.68
CLK1-211ENST00000481641 NCAPD2Q15021 1401 aa25.55■■□□□ 1.68
CLK1-211ENST00000481641 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CLK1-211ENST00000481641 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CLK1-211ENST00000481641 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.53■■□□□ 1.68
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CLK1-211ENST00000481641 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.53■■□□□ 1.68
CLK1-211ENST00000481641 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.53■■□□□ 1.68
CLK1-211ENST00000481641 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.53■■□□□ 1.68
CLK1-211ENST00000481641 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CLK1-211ENST00000481641 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.51■■□□□ 1.68
CLK1-211ENST00000481641 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK1-211ENST00000481641 SYT17Q9BSW7 474 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK1-211ENST00000481641 SPG7Q9UQ90 795 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK1-211ENST00000481641 ITGB4P16144 1822 aa25.49■■□□□ 1.67
CLK1-211ENST00000481641 ARXQ96QS3 562 aa25.48■■□□□ 1.67
CLK1-211ENST00000481641 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.47■■□□□ 1.67
CLK1-211ENST00000481641 PALLDQ8WX93 1383 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK1-211ENST00000481641 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CLK1-211ENST00000481641 MORC1Q86VD1 984 aa25.46■■□□□ 1.67
CLK1-211ENST00000481641 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.45■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 PIGBQ92521 554 aa25.45■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 YY1P25490 414 aa25.44■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.43■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.661e-10■■□□□ 13.7
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CLK1-211ENST00000481641 PHKG2P15735 406 aa25.42■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 C5P01031 1676 aa25.42■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.41■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.41■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 KLHL34Q8N239 644 aa25.4■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.4■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 POLD1P28340 1107 aa25.39■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CLK1-211ENST00000481641 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.38■■□□□ 1.65
CLK1-211ENST00000481641 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CLK1-211ENST00000481641 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.37■■□□□ 1.65
CLK1-211ENST00000481641 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.37■■□□□ 1.65
CLK1-211ENST00000481641 MSL1Q68DK7 614 aa25.36■■□□□ 1.65
CLK1-211ENST00000481641 SMIM5Q71RC9 77 aa25.36■■□□□ 1.65
CLK1-211ENST00000481641 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.36■■□□□ 1.65
CLK1-211ENST00000481641 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.35■■□□□ 1.65
CLK1-211ENST00000481641 MAP3K5Q99683 1374 aa25.34■■□□□ 1.65
CLK1-211ENST00000481641 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.33■■□□□ 1.65
CLK1-211ENST00000481641 C4BP0C0L5 1744 aa25.33■■□□□ 1.65
CLK1-211ENST00000481641 SIK1P57059 783 aa25.33■■□□□ 1.65
CLK1-211ENST00000481641 UTRNP46939 3433 aa25.32■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 AK7Q96M32 723 aa25.32■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 ATG3Q9NT62 314 aa25.32■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.31■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 PHF14O94880 888 aa25.3■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 IL13P35225 146 aa25.3■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 ITPK1Q13572 414 aa25.3■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.3■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.3■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 ATP6V1AP38606 617 aa25.28■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.28■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.28■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 DCAF5Q96JK2 942 aa25.27■■□□□ 1.64
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