RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
NELFE-208ENST00000481121 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
NELFE-208ENST00000481121 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
NELFE-208ENST00000481121 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
NELFE-208ENST00000481121 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.27■■■□□ 2.12
NELFE-208ENST00000481121 BTAF1O14981 1849 aa28.26■■■□□ 2.12
NELFE-208ENST00000481121 EYA1Q99502 592 aa28.26■■■□□ 2.11
NELFE-208ENST00000481121 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
NELFE-208ENST00000481121 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
NELFE-208ENST00000481121 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.25■■■□□ 2.11
NELFE-208ENST00000481121 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
NELFE-208ENST00000481121 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
NELFE-208ENST00000481121 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.21■■■□□ 2.11
NELFE-208ENST00000481121 MTHFSP49914 203 aa28.2■■■□□ 2.1
NELFE-208ENST00000481121 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.2■■■□□ 2.1
NELFE-208ENST00000481121 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.2■■■□□ 2.1
NELFE-208ENST00000481121 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.2■■■□□ 2.1
NELFE-208ENST00000481121 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.19■■■□□ 2.1
NELFE-208ENST00000481121 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.19■■■□□ 2.1
NELFE-208ENST00000481121 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.17■■■□□ 2.1
NELFE-208ENST00000481121 KCNQ2O43526 872 aa28.16■■■□□ 2.1
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.15■■■□□ 2.1
NELFE-208ENST00000481121 ITGB4P16144 1822 aa28.15■■■□□ 2.1
NELFE-208ENST00000481121 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
NELFE-208ENST00000481121 PLSCR1O15162 318 aa28.13■■■□□ 2.09
NELFE-208ENST00000481121 IL13P35225 146 aa28.13■■■□□ 2.09
NELFE-208ENST00000481121 SPG7Q9UQ90 795 aa28.13■■■□□ 2.09
NELFE-208ENST00000481121 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.092e-7■■□□□ 13.6
NELFE-208ENST00000481121 KDRP35968 1356 aa28.1■■■□□ 2.09
NELFE-208ENST00000481121 CYP27B1O15528 508 aa28.09■■■□□ 2.09
NELFE-208ENST00000481121 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
NELFE-208ENST00000481121 LY75O60449 1722 aa28.08■■■□□ 2.09
NELFE-208ENST00000481121 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
NELFE-208ENST00000481121 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.08■■■□□ 2.08
NELFE-208ENST00000481121 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.07■■■□□ 2.08
NELFE-208ENST00000481121 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
NELFE-208ENST00000481121 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
NELFE-208ENST00000481121 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
NELFE-208ENST00000481121 PPP2R1AP30153 589 aa28.03■■■□□ 2.08
NELFE-208ENST00000481121 CFAP53Q96M91 514 aa28.02■■■□□ 2.08
NELFE-208ENST00000481121 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
NELFE-208ENST00000481121 TXNRD1Q16881 649 aa28.02■■■□□ 2.08
NELFE-208ENST00000481121 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.02■■■□□ 2.08
NELFE-208ENST00000481121 PHKG2P15735 406 aa28.01■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 PAPPAQ13219 1627 aa28■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 AMOTQ4VCS5 1084 aa28■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 NBPF14Q5TI25 921 aa28■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 HMOX1P09601 288 aa27.99■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 PROM2Q8N271 834 aa27.99■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.98■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.97■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
NELFE-208ENST00000481121 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.95■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.93■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 LRP5O75197 1615 aa27.93■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 C5P01031 1676 aa27.93■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.93■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 CASZ1Q86V15 1759 aa27.91■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.9■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 DCAF5Q96JK2 942 aa27.9■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.9■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 NUDCQ9Y266 331 aa27.9■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.9■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.89■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 RALBP1Q15311 655 aa27.89■■■□□ 2.06
NELFE-208ENST00000481121 PALLDQ8WX93 1383 aa27.89■■■□□ 2.05
NELFE-208ENST00000481121 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.87■■■□□ 2.05
NELFE-208ENST00000481121 STK32BQ9NY57 414 aa27.87■■■□□ 2.05
NELFE-208ENST00000481121 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.87■■■□□ 2.05
NELFE-208ENST00000481121 PIGBQ92521 554 aa27.87■■■□□ 2.05
NELFE-208ENST00000481121 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
NELFE-208ENST00000481121 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.84■■■□□ 2.05
NELFE-208ENST00000481121 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.84■■■□□ 2.05
NELFE-208ENST00000481121 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
NELFE-208ENST00000481121 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
NELFE-208ENST00000481121 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
NELFE-208ENST00000481121 SLC15A2Q16348 729 aa27.83■■■□□ 2.05
NELFE-208ENST00000481121 KCNQ4P56696 695 aa27.82■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.82■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 MRC1P22897 1456 aa27.8■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 PRKAR2BP31323 418 aa27.8■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 CABP4P57796 275 aa27.8■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.8■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 C4BP0C0L5 1744 aa27.8■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 ZNF827Q17R98 1081 aa27.79■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.78■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.77■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.04
NELFE-208ENST00000481121 MAP3K5Q99683 1374 aa27.76■■■□□ 2.03
NELFE-208ENST00000481121 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms