RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
ACTB-211ENST00000480301 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
ACTB-211ENST00000480301 SBF2Q86WG5 1849 aa28.47■■■□□ 2.15
ACTB-211ENST00000480301 MTHFSP49914 203 aa28.46■■■□□ 2.15
ACTB-211ENST00000480301 KCNQ2O43526 872 aa28.44■■■□□ 2.14
ACTB-211ENST00000480301 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.44■■■□□ 2.14
ACTB-211ENST00000480301 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.43■■■□□ 2.14
ACTB-211ENST00000480301 IL13P35225 146 aa28.41■■■□□ 2.14
ACTB-211ENST00000480301 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.4■■■□□ 2.14
ACTB-211ENST00000480301 PLSCR1O15162 318 aa28.4■■■□□ 2.14
ACTB-211ENST00000480301 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.39■■■□□ 2.14
ACTB-211ENST00000480301 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.37■■■□□ 2.13
ACTB-211ENST00000480301 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.37■■■□□ 2.13
ACTB-211ENST00000480301 CYP27B1O15528 508 aa28.36■■■□□ 2.13
ACTB-211ENST00000480301 NHSQ6T4R5 1651 aa28.35■■■□□ 2.13
ACTB-211ENST00000480301 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
ACTB-211ENST00000480301 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.34■■■□□ 2.13
ACTB-211ENST00000480301 SPG7Q9UQ90 795 aa28.34■■■□□ 2.13
ACTB-211ENST00000480301 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 PROM2Q8N271 834 aa28.32■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.32■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.31■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.31■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R1AP30153 589 aa28.3■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.3■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 RREB1Q92766 1687 aa28.29■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 KDRP35968 1356 aa28.29■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.27■■■□□ 2.12
ACTB-211ENST00000480301 PHKG2P15735 406 aa28.26■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 TXNRD1Q16881 649 aa28.26■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.26■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.25■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 BTAF1O14981 1849 aa28.25■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.24■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.24■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 HMOX1P09601 288 aa28.22■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 NBPF14Q5TI25 921 aa28.22■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 CFAP53Q96M91 514 aa28.21■■■□□ 2.11
ACTB-211ENST00000480301 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
ACTB-211ENST00000480301 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
ACTB-211ENST00000480301 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.18■■■□□ 2.1
ACTB-211ENST00000480301 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ACTB-211ENST00000480301 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.17■■■□□ 2.1
ACTB-211ENST00000480301 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.16■■■□□ 2.1
ACTB-211ENST00000480301 PIGBQ92521 554 aa28.15■■■□□ 2.1
ACTB-211ENST00000480301 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
ACTB-211ENST00000480301 RALBP1Q15311 655 aa28.14■■■□□ 2.1
ACTB-211ENST00000480301 DCAF5Q96JK2 942 aa28.13■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.12■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.12■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 NUDCQ9Y266 331 aa28.12■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 ITGB4P16144 1822 aa28.1■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.09■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 STK32BQ9NY57 414 aa28.09■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.09■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 KCNQ4P56696 695 aa28.08■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 SLC15A2Q16348 729 aa28.08■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.08■■■□□ 2.09
ACTB-211ENST00000480301 PALLDQ8WX93 1383 aa28.07■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 LY75O60449 1722 aa28.06■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.083e-42■□□□□ 8.5
ACTB-211ENST00000480301 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.06■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 PAPPAQ13219 1627 aa28.05■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.04■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 PRKAR2BP31323 418 aa28.03■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 ZNF827Q17R98 1081 aa28.03■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 AKT1S1Q96B36 256 aa28.03■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 FCHSD2O94868 740 aa28.02■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 CABP4P57796 275 aa28.02■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.02■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 ATG3Q9NT62 314 aa28.02■■■□□ 2.08
ACTB-211ENST00000480301 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
ACTB-211ENST00000480301 LGR6Q9HBX8 967 aa28.01■■■□□ 2.07
ACTB-211ENST00000480301 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
ACTB-211ENST00000480301 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
ACTB-211ENST00000480301 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.99■■■□□ 2.07
ACTB-211ENST00000480301 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.99■■■□□ 2.07
ACTB-211ENST00000480301 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
ACTB-211ENST00000480301 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.96■■■□□ 2.07
ACTB-211ENST00000480301 SIK1P57059 783 aa27.96■■■□□ 2.07
ACTB-211ENST00000480301 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.95■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.94■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.93■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K5Q99683 1374 aa27.93■■■□□ 2.06
ACTB-211ENST00000480301 CASZ1Q86V15 1759 aa27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 240.7 ms