RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 TATP17735 454 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
ARHGEF3-208ENST00000477440 PTF1AQ7RTS3 328 aa34.47■■■■□ 3.11
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
ARHGEF3-208ENST00000477440 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
ARHGEF3-208ENST00000477440 MTHFSP49914 203 aa34.45■■■■□ 3.11
ARHGEF3-208ENST00000477440 IGSF1Q8N6C5 1336 aa34.44■■■■□ 3.1
ARHGEF3-208ENST00000477440 RREB1Q92766 1687 aa34.44■■■■□ 3.1
ARHGEF3-208ENST00000477440 DOT1LQ8TEK3 1739 aa34.44■■■■□ 3.1
ARHGEF3-208ENST00000477440 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
ARHGEF3-208ENST00000477440 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa34.42■■■■□ 3.1
ARHGEF3-208ENST00000477440 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
ARHGEF3-208ENST00000477440 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF3-208ENST00000477440 ACSBG1Q96GR2 724 aa34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF3-208ENST00000477440 CAMKK2Q96RR4 588 aa34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF3-208ENST00000477440 BTAF1O14981 1849 aa34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF3-208ENST00000477440 KCNQ2O43526 872 aa34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF3-208ENST00000477440 NUP188Q5SRE5 1749 aa34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF3-208ENST00000477440 IL13P35225 146 aa34.37■■■■□ 3.09
ARHGEF3-208ENST00000477440 PARD3Q8TEW0 1356 aa34.36■■■■□ 3.09
ARHGEF3-208ENST00000477440 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF3-208ENST00000477440 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF3-208ENST00000477440 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF3-208ENST00000477440 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
ARHGEF3-208ENST00000477440 AEBP1Q8IUX7 1158 aa34.32■■■■□ 3.08
ARHGEF3-208ENST00000477440 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa34.32■■■■□ 3.08
ARHGEF3-208ENST00000477440 CYP27B1O15528 508 aa34.31■■■■□ 3.08
ARHGEF3-208ENST00000477440 PLSCR1O15162 318 aa34.29■■■■□ 3.08
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPG7Q9UQ90 795 aa34.29■■■■□ 3.08
ARHGEF3-208ENST00000477440 KDRP35968 1356 aa34.28■■■■□ 3.08
ARHGEF3-208ENST00000477440 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa34.28■■■■□ 3.08
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PPP2R1AP30153 589 aa34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF3-208ENST00000477440 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF3-208ENST00000477440 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF3-208ENST00000477440 ITGB4P16144 1822 aa34.26■■■■□ 3.08
ARHGEF3-208ENST00000477440 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
ARHGEF3-208ENST00000477440 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
ARHGEF3-208ENST00000477440 PROM2Q8N271 834 aa34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF3-208ENST00000477440 HMOX1P09601 288 aa34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF3-208ENST00000477440 PHKG2P15735 406 aa34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF3-208ENST00000477440 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF3-208ENST00000477440 IFNL2Q8IZJ0 200 aa34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF3-208ENST00000477440 CFAP53Q96M91 514 aa34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF3-208ENST00000477440 LY75O60449 1722 aa34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF3-208ENST00000477440 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF3-208ENST00000477440 TXNRD1Q16881 649 aa34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF3-208ENST00000477440 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF3-208ENST00000477440 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF3-208ENST00000477440 AMOTQ4VCS5 1084 aa34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF3-208ENST00000477440 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF3-208ENST00000477440 PAPPAQ13219 1627 aa34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF3-208ENST00000477440 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF3-208ENST00000477440 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
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ARHGEF3-208ENST00000477440 NBPF14Q5TI25 921 aa34.07■■■■□ 3.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 SCN11AQ9UI33 1791 aa34.06■■■■□ 3.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 RALBP1Q15311 655 aa34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 C1orf141Q5JVX7 400 aa34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 LRRC4BQ9NT99 713 aa34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 PIGBQ92521 554 aa34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 NUDCQ9Y266 331 aa34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 DCAF5Q96JK2 942 aa34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMOD3Q9NYL9 352 aa34■■■■□ 3.03
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ARHGEF3-208ENST00000477440 KCNQ4P56696 695 aa33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 RSPH6AQ9H0K4 717 aa33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLC27A3Q5K4L6 730 aa33.98■■■■□ 3.03
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ARHGEF3-208ENST00000477440 AKAP4Q5JQC9 854 aa33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERVV-2B6SEH9 535 aa33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 C5P01031 1676 aa33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 CASZ1Q86V15 1759 aa33.95■■■■□ 3.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 PRKAR2BP31323 418 aa33.95■■■■□ 3.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 STK32BQ9NY57 414 aa33.95■■■■□ 3.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
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ARHGEF3-208ENST00000477440 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa33.95■■■■□ 3.02
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLC15A2Q16348 729 aa33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF3-208ENST00000477440 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
ARHGEF3-208ENST00000477440 ASAP1Q9ULH1 1129 aa33.92■■■■□ 3.02
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF827Q17R98 1081 aa33.91■■■■□ 3.02
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF3-208ENST00000477440 CABP4P57796 275 aa33.9■■■■□ 3.02
ARHGEF3-208ENST00000477440 QSER1Q2KHR3 1735 aa33.9■■■■□ 3.02
ARHGEF3-208ENST00000477440 MRC1P22897 1456 aa33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF3-208ENST00000477440 FCHSD2O94868 740 aa33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF3-208ENST00000477440 GAS2L2Q8NHY3 880 aa33.88■■■■□ 3.01
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ATG3Q9NT62 314 aa33.88■■■■□ 3.01
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