RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-217ENST00000475693 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-217ENST00000475693 LGR6Q9HBX8 967 aa23.58■■□□□ 1.37
ATG4B-217ENST00000475693 ABCC6O95255 1503 aa23.58■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 IL17REQ8NFR9 667 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 LRP6O75581 1613 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 NGLY1Q96IV0 654 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 MAP3K5Q99683 1374 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 MBIPQ9NS73 344 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 CRB1P82279 1406 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-217ENST00000475693 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.52■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 CYP27B1O15528 508 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 IL2RBP14784 551 aa23.5■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 KRT24Q2M2I5 525 aa23.5■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF853P0CG23 659 aa23.49■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.49■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.49■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.49■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 IL16Q14005 1332 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 PLIN1O60240 522 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 CFAP44Q96MT7 982 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 TSPYL6Q8N831 410 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 IFT57Q9NWB7 429 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 SPG7Q9UQ90 795 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 SLIT2O94813 1529 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 BCAR3O75815 825 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 PHKG2P15735 406 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 GNAI1P63096 354 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.45■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.45■■□□□ 1.35
ATG4B-217ENST00000475693 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.45■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 CHL1O00533 1208 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 USP21Q9UK80 565 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 FKBP8Q14318 412 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 NRAPQ86VF7 1730 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 KCNQ3O43525 872 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 AFF2P51816 1311 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
ATG4B-217ENST00000475693 TEFQ10587 303 aa23.39■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 NEFLP07196 543 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 DISP2A7MBM2 1401 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 VAMP4O75379 141 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 SLC39A6Q13433 755 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 BTBD11A6QL63 1104 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 EXOC5O00471 708 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 VPS72Q15906 364 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC37A3O60309 1634 aa23.34■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.34■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 DCAF5Q96JK2 942 aa23.34■■□□□ 1.33
ATG4B-217ENST00000475693 TNNQ9UQP3 1299 aa23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms