RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.71e-8■■■■■ 36.5
SYF2-203ENST00000474160 PLSCR1O15162 318 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-203ENST00000474160 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 MTHFSP49914 203 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 NHSQ6T4R5 1651 aa25.61■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 SPG7Q9UQ90 795 aa25.61■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.6■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.6■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 IL13P35225 146 aa25.59■■□□□ 1.69
SYF2-203ENST00000474160 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SYF2-203ENST00000474160 KDRP35968 1356 aa25.56■■□□□ 1.68
SYF2-203ENST00000474160 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
SYF2-203ENST00000474160 RREB1Q92766 1687 aa25.55■■□□□ 1.68
SYF2-203ENST00000474160 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.54■■□□□ 1.68
SYF2-203ENST00000474160 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SYF2-203ENST00000474160 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-203ENST00000474160 CFAP53Q96M91 514 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-203ENST00000474160 CYP27B1O15528 508 aa25.52■■□□□ 1.68
SYF2-203ENST00000474160 KCNQ2O43526 872 aa25.52■■□□□ 1.68
SYF2-203ENST00000474160 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.51■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.5■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.5■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 PPP2R1AP30153 589 aa25.49■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 NBPF14Q5TI25 921 aa25.49■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.48■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.48■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 BTAF1O14981 1849 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.46■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 PHKG2P15735 406 aa25.46■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SYF2-203ENST00000474160 RALBP1Q15311 655 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-203ENST00000474160 TXNRD1Q16881 649 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-203ENST00000474160 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-203ENST00000474160 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SYF2-203ENST00000474160 NUDCQ9Y266 331 aa25.45■■□□□ 1.66
SYF2-203ENST00000474160 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.42■■□□□ 1.66
SYF2-203ENST00000474160 PROM2Q8N271 834 aa25.42■■□□□ 1.66
SYF2-203ENST00000474160 DCAF5Q96JK2 942 aa25.41■■□□□ 1.66
SYF2-203ENST00000474160 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.4■■□□□ 1.66
SYF2-203ENST00000474160 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SYF2-203ENST00000474160 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.38■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 HMOX1P09601 288 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.36■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.36■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.35■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 LY75O60449 1722 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 ITGB4P16144 1822 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 STK32BQ9NY57 414 aa25.33■■□□□ 1.65
SYF2-203ENST00000474160 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 PIGBQ92521 554 aa25.32■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 PAPPAQ13219 1627 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 FCHSD2O94868 740 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 PALLDQ8WX93 1383 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 SLC15A2Q16348 729 aa25.3■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.29■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.29■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 CABP4P57796 275 aa25.27■■□□□ 1.64
SYF2-203ENST00000474160 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 PRKAR2BP31323 418 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 LRP5O75197 1615 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.24■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.23■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 AKT1S1Q96B36 256 aa25.23■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 MRC1P22897 1456 aa25.22■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 MAP3K5Q99683 1374 aa25.22■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 NEFMP07197 916 aa25.22■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 SIK1P57059 783 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 ATG3Q9NT62 314 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.21■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.2■■□□□ 1.63
SYF2-203ENST00000474160 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms