RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469389.5

SYP-204, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-204ENST00000469389 MIER1Q8N108 512 aa20.98■□□□□ 0.95
SYP-204ENST00000469389 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.98■□□□□ 0.95
SYP-204ENST00000469389 KDRP35968 1356 aa20.97■□□□□ 0.95
SYP-204ENST00000469389 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.97■□□□□ 0.95
SYP-204ENST00000469389 NCAPD2Q15021 1401 aa20.97■□□□□ 0.95
SYP-204ENST00000469389 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.97■□□□□ 0.95
SYP-204ENST00000469389 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SYP-204ENST00000469389 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.95■□□□□ 0.95
SYP-204ENST00000469389 DISP2A7MBM2 1401 aa20.95■□□□□ 0.95
SYP-204ENST00000469389 PRKAR2BP31323 418 aa20.95■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 MEGF6O75095 1541 aa20.94■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.94■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.94■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.94■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.94■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.94■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.93■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 RGS12O14924 1447 aa20.93■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 TNS2Q63HR2 1409 aa20.93■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 CCDC184Q52MB2 194 aa20.92■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.92■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.92■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 LRRC37A3O60309 1634 aa20.92■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.91■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SYP-204ENST00000469389 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.89■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 RUNDC1Q96C34 613 aa20.89■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.87■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.87■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.86■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.86■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.85■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.83■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 PHKG2P15735 406 aa20.83■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.83■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.83■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.83■□□□□ 0.93
SYP-204ENST00000469389 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.82■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 CYP27B1O15528 508 aa20.81■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 NFE2L2Q16236 605 aa20.81■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 DCAF5Q96JK2 942 aa20.81■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 MAP3K5Q99683 1374 aa20.81■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.79■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 FAM182BQ5T319 152 aa20.79■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 RIPK4P57078 832 aa20.78■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 NEUROD2Q15784 382 aa20.78■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
SYP-204ENST00000469389 APAF1O14727 1248 aa20.76■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.76■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 CABP4P57796 275 aa20.75■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 TEFQ10587 303 aa20.75■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 NGEFQ8N5V2 710 aa20.75■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.75■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 BCL9O00512 1426 aa20.75■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.74■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.74■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 TRIM37O94972 964 aa20.72■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.72■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.71■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 CCDC125Q86Z20 511 aa20.71■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
SYP-204ENST00000469389 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.7■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 ILDR2Q71H61 639 aa20.7■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 MCM10Q7L590 875 aa20.7■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 LGR6Q9HBX8 967 aa20.69■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 NHSQ6T4R5 1651 aa20.68■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.68■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 SBF2Q86WG5 1849 aa20.68■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 IL17REQ8NFR9 667 aa20.67■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 APBA3O96018 575 aa20.66■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 DCTN1Q14203 1278 aa20.66■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.66■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 ITGB4P16144 1822 aa20.65■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 KCNQ2O43526 872 aa20.65■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 BAG6P46379 1132 aa20.65■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 CCDC27Q2M243 656 aa20.65■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.65■□□□□ 0.9
SYP-204ENST00000469389 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.64■□□□□ 0.89
SYP-204ENST00000469389 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SYP-204ENST00000469389 PIGBQ92521 554 aa20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms