RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468253.1

NPHP4-206, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 2

Gene NPHP4, Length 781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-206ENST00000468253 RALBP1Q15311 655 aa26.99■■□□□ 1.91
NPHP4-206ENST00000468253 SPG7Q9UQ90 795 aa26.99■■□□□ 1.91
NPHP4-206ENST00000468253 MEGF6O75095 1541 aa26.99■■□□□ 1.91
NPHP4-206ENST00000468253 CFAP53Q96M91 514 aa26.98■■□□□ 1.91
NPHP4-206ENST00000468253 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.97■■□□□ 1.91
NPHP4-206ENST00000468253 APBA3O96018 575 aa26.96■■□□□ 1.91
NPHP4-206ENST00000468253 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.96■■□□□ 1.91
NPHP4-206ENST00000468253 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.95■■□□□ 1.91
NPHP4-206ENST00000468253 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.95■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.94■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.94■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 PLSCR1O15162 318 aa26.93■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.93■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.93■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 KDRP35968 1356 aa26.93■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 CYP27B1O15528 508 aa26.92■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.92■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 KCNQ2O43526 872 aa26.9■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.9■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 NUDCQ9Y266 331 aa26.9■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.89■■□□□ 1.9
NPHP4-206ENST00000468253 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.88■■□□□ 1.89
NPHP4-206ENST00000468253 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.87■■□□□ 1.89
NPHP4-206ENST00000468253 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
NPHP4-206ENST00000468253 PHKG2P15735 406 aa26.85■■□□□ 1.89
NPHP4-206ENST00000468253 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
NPHP4-206ENST00000468253 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
NPHP4-206ENST00000468253 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
NPHP4-206ENST00000468253 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.84■■□□□ 1.89
NPHP4-206ENST00000468253 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
NPHP4-206ENST00000468253 HMOX1P09601 288 aa26.83■■□□□ 1.89
NPHP4-206ENST00000468253 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
NPHP4-206ENST00000468253 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
NPHP4-206ENST00000468253 FCHSD2O94868 740 aa26.79■■□□□ 1.88
NPHP4-206ENST00000468253 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
NPHP4-206ENST00000468253 PROM2Q8N271 834 aa26.78■■□□□ 1.88
NPHP4-206ENST00000468253 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
NPHP4-206ENST00000468253 DCAF5Q96JK2 942 aa26.78■■□□□ 1.88
NPHP4-206ENST00000468253 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
NPHP4-206ENST00000468253 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
NPHP4-206ENST00000468253 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.77■■□□□ 1.88
NPHP4-206ENST00000468253 SBF2Q86WG5 1849 aa26.76■■□□□ 1.88
NPHP4-206ENST00000468253 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.76■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.75■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.75■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.74■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 TXNRD1Q16881 649 aa26.73■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.73■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 NBPF14Q5TI25 921 aa26.72■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.72■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.71■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.71■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 PIGBQ92521 554 aa26.71■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 NHSQ6T4R5 1651 aa26.7■■□□□ 1.87
NPHP4-206ENST00000468253 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
NPHP4-206ENST00000468253 PRKAR2BP31323 418 aa26.7■■□□□ 1.86
NPHP4-206ENST00000468253 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
NPHP4-206ENST00000468253 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
NPHP4-206ENST00000468253 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.7■■□□□ 1.86
NPHP4-206ENST00000468253 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.69■■□□□ 1.86
NPHP4-206ENST00000468253 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.68■■□□□ 1.86
NPHP4-206ENST00000468253 CABP4P57796 275 aa26.65■■□□□ 1.86
NPHP4-206ENST00000468253 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.63■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 ANP32CO43423 234 aa26.63■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.62■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 NEFMP07197 916 aa26.62■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.62■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 LGR6Q9HBX8 967 aa26.62■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.62■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.61■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 ATG3Q9NT62 314 aa26.6■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.59■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 BTAF1O14981 1849 aa26.59■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.58■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
NPHP4-206ENST00000468253 PALLDQ8WX93 1383 aa26.58■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.57■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 SLC15A2Q16348 729 aa26.57■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 IL17REQ8NFR9 667 aa26.57■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 STK32BQ9NY57 414 aa26.57■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 MAP3K5Q99683 1374 aa26.57■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 RREB1Q92766 1687 aa26.54■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.54■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 SIK1P57059 783 aa26.54■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 AKT1S1Q96B36 256 aa26.53■■□□□ 1.84
NPHP4-206ENST00000468253 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms