RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464025.5

LMO2-204, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMO2, Length 1,550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-204ENST00000464025 MCM10Q7L590 875 aa22.12■■□□□ 1.13
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LMO2-204ENST00000464025 IP6K1Q92551 441 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-204ENST00000464025 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.1■■□□□ 1.13
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LMO2-204ENST00000464025 USP19O94966 1318 aa22.07■■□□□ 1.12
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LMO2-204ENST00000464025 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-204ENST00000464025 GCC1Q96CN9 775 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-204ENST00000464025 MST1RQ04912 1400 aa22.06■■□□□ 1.12
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LMO2-204ENST00000464025 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-204ENST00000464025 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.06■■□□□ 1.12
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LMO2-204ENST00000464025 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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LMO2-204ENST00000464025 KRT24Q2M2I5 525 aa22■■□□□ 1.11
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LMO2-204ENST00000464025 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.98■■□□□ 1.11
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LMO2-204ENST00000464025 ORAI2Q96SN7 254 aa21.98■■□□□ 1.11
LMO2-204ENST00000464025 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.97■■□□□ 1.11
LMO2-204ENST00000464025 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.97■■□□□ 1.11
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LMO2-204ENST00000464025 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.83■■□□□ 1.09
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LMO2-204ENST00000464025 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.82■■□□□ 1.08
LMO2-204ENST00000464025 RGPD5Q99666 1765 aa21.82■■□□□ 1.08
LMO2-204ENST00000464025 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LMO2-204ENST00000464025 SLC4A3P48751 1232 aa21.82■■□□□ 1.08
LMO2-204ENST00000464025 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
LMO2-204ENST00000464025 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
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