RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 CDC45O75419 566 aa25.47■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.47■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.47■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF10O15013 1369 aa25.47■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 SLC4A2P04920 1241 aa25.47■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 KIF2CQ99661 725 aa25.47■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 MSH6P52701 1360 aa25.47■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 CRB1P82279 1406 aa25.47■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.46■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 AMPHP49418 695 aa25.46■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 FLT4P35916 1363 aa25.45■■□□□ 1.67
IMP4-208ENST00000460766 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.45■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 CEP85Q6P2H3 762 aa25.45■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 ATP10DQ9P241 1426 aa25.44■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.44■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 MEIS3Q99687 375 aa25.44■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.44■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 SBNO1A3KN83 1393 aa25.44■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 TBX22Q9Y458 520 aa25.44■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 APBB1O00213 710 aa25.42■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 RTL1A6NKG5 1358 aa25.42■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 EYA1Q99502 592 aa25.41■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 DDIT3P35638 169 aa25.41■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 TTC22Q5TAA0 569 aa25.41■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.4■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
IMP4-208ENST00000460766 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 NLRP6P59044 892 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 KDRP35968 1356 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 F6X3S4 739 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 TRAK2O60296 914 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 G2E3Q7L622 706 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 ARXQ96QS3 562 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.37■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 DIP2AQ14689 1571 aa25.37■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 SLIT1O75093 1534 aa25.37■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.37■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.36■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.36■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 STK31Q9BXU1 1019 aa25.33■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 HMMRO75330 724 aa25.33■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
IMP4-208ENST00000460766 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.32■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.32■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 SDSP20132 328 aa25.32■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 KCNA6P17658 529 aa25.3■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.3■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 CASC1Q6TDU7 716 aa25.3■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 PIK3C2AO00443 1686 aa25.3■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.3■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 HOXC9P31274 260 aa25.3■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 NECTIN2Q92692 538 aa25.29■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 GBP4Q96PP9 640 aa25.29■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 ABTB2Q8N961 1025 aa25.28■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 USP26Q9BXU7 913 aa25.28■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 RABEP1Q15276 862 aa25.27■■□□□ 1.64
IMP4-208ENST00000460766 GNAI2P04899 355 aa25.26■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.26■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 FSD2A1L4K1 749 aa25.26■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 FLIIQ13045 1269 aa25.26■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 C14orf37Q86TY3 774 aa25.26■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.25■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.23■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 IL17REQ8NFR9 667 aa25.23■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 MAP3K5Q99683 1374 aa25.22■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 PDE1AP54750 535 aa25.21■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.2■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
IMP4-208ENST00000460766 REC8O95072 547 aa25.2■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 GNAI3P08754 354 aa25.2■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 SSFA2P28290 1259 aa25.19■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.19■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.18■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.18■■□□□ 1.62
IMP4-208ENST00000460766 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.18■■□□□ 1.62
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