RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, human

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP5-208	ENST00000459627	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SH3BP5-208	ENST00000459627	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SH3BP5-208	ENST00000459627	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SH3BP5-208	ENST00000459627	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SH3BP5-208	ENST00000459627	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SH3BP5-208	ENST00000459627	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
SH3BP5-208	ENST00000459627	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
SH3BP5-208	ENST00000459627	EYA1	Q99502	592 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SH3BP5-208	ENST00000459627	PLSCR1	O15162	318 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP5-208	ENST00000459627	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP5-208	ENST00000459627	PROM2	Q8N271	834 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP5-208	ENST00000459627	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SH3BP5-208	ENST00000459627	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SH3BP5-208	ENST00000459627	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
SH3BP5-208	ENST00000459627	BTAF1	O14981	1849 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SH3BP5-208	ENST00000459627	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SH3BP5-208	ENST00000459627	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
SH3BP5-208	ENST00000459627	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SH3BP5-208	ENST00000459627	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
SH3BP5-208	ENST00000459627	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SH3BP5-208	ENST00000459627	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
SH3BP5-208	ENST00000459627	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SH3BP5-208	ENST00000459627	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SH3BP5-208	ENST00000459627	CYP27B1	O15528	508 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SH3BP5-208	ENST00000459627	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SH3BP5-208	ENST00000459627	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SH3BP5-208	ENST00000459627	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SH3BP5-208	ENST00000459627	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SH3BP5-208	ENST00000459627	MTHFS	P49914	203 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SH3BP5-208	ENST00000459627	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SH3BP5-208	ENST00000459627	KCNQ4	P56696	695 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP5-208	ENST00000459627	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SH3BP5-208	ENST00000459627	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SH3BP5-208	ENST00000459627	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SH3BP5-208	ENST00000459627	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SH3BP5-208	ENST00000459627	IL13	P35225	146 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SH3BP5-208	ENST00000459627	LRP5	O75197	1615 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SH3BP5-208	ENST00000459627	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SH3BP5-208	ENST00000459627	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SH3BP5-208	ENST00000459627	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SH3BP5-208	ENST00000459627	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SH3BP5-208	ENST00000459627	PHKG2	P15735	406 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SH3BP5-208	ENST00000459627	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.4	■■■□□ 2.78
SH3BP5-208	ENST00000459627	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SH3BP5-208	ENST00000459627	ITGB4	P16144	1822 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SH3BP5-208	ENST00000459627	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SH3BP5-208	ENST00000459627	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SH3BP5-208	ENST00000459627	LY75	O60449	1722 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SH3BP5-208	ENST00000459627	HMOX1	P09601	288 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SH3BP5-208	ENST00000459627	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SH3BP5-208	ENST00000459627	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SH3BP5-208	ENST00000459627	PIGB	Q92521	554 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZBTB7A	O95365	584 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SH3BP5-208	ENST00000459627	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SH3BP5-208	ENST00000459627	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
SH3BP5-208	ENST00000459627	KDR	P35968	1356 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SH3BP5-208	ENST00000459627	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SH3BP5-208	ENST00000459627	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SH3BP5-208	ENST00000459627	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
SH3BP5-208	ENST00000459627	SPON1	Q9HCB6	807 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SH3BP5-208	ENST00000459627	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SH3BP5-208	ENST00000459627	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SH3BP5-208	ENST00000459627	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	PPP2R1A	P30153	589 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
SH3BP5-208	ENST00000459627	C5	P01031	1676 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	CABP4	P57796	275 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	PTGER2	P43116	358 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	CFAP53	Q96M91	514 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	SMIM5	Q71RC9	77 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	SIK1	P57059	783 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	MTFR1L	Q9H019	292 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SH3BP5-208	ENST00000459627	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	MSH5	O43196	834 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	ITPK1	Q13572	414 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.12	■■■□□ 2.73

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