RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.84■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NRAPQ86VF7 1730 aa19.84■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CRB1P82279 1406 aa19.84■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.83■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GNAT3A8MTJ3 354 aa19.82■□□□□ 0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAP3K5Q99683 1374 aa19.82■□□□□ 0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.762e-9■□□□□ 10.9
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MEGF6O75095 1541 aa19.81■□□□□ 0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GNAI1P63096 354 aa19.78■□□□□ 0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DCTN1Q14203 1278 aa19.78■□□□□ 0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.78■□□□□ 0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa19.77■□□□□ 0.76
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IFT57Q9NWB7 429 aa19.77■□□□□ 0.76
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRRC37A3O60309 1634 aa19.76■□□□□ 0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WNK3Q9BYP7 1800 aa19.76■□□□□ 0.75
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C8orf37Q96NL8 207 aa19.76■□□□□ 0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CFAP44Q96MT7 982 aa19.75■□□□□ 0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.75■□□□□ 0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 USP35Q9P2H5 1018 aa19.74■□□□□ 0.75
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IFNL2Q8IZJ0 200 aa19.72■□□□□ 0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IL17REQ8NFR9 667 aa19.72■□□□□ 0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SHANK3Q9BYB0 1731 aa19.71■□□□□ 0.75
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DISP2A7MBM2 1401 aa19.7■□□□□ 0.74
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BCL9LQ86UU0 1499 aa19.7■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa19.7■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa19.7■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa19.7■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa19.7■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LGR6Q9HBX8 967 aa19.69■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.69■□□□□ 0.74
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 VPS72Q15906 364 aa19.68■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa19.68■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CYP27B1O15528 508 aa19.67■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TEFQ10587 303 aa19.67■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 USP21Q9UK80 565 aa19.67■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DCAF5Q96JK2 942 aa19.66■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TSPYL4Q9UJ04 414 aa19.66■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NEFLP07196 543 aa19.65■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BARGINQ6ZT62 677 aa19.65■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.65■□□□□ 0.74
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.63■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AFF2P51816 1311 aa19.63■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EXOC5O00471 708 aa19.63■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TNS2Q63HR2 1409 aa19.62■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF428Q96B54 188 aa19.62■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MIS18AQ9NYP9 233 aa19.62■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MRC1P22897 1456 aa19.61■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.61■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa19.6■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BTBD11A6QL63 1104 aa19.59■□□□□ 0.73
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DDB1Q16531 1140 aa19.59■□□□□ 0.73
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