RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	19.74	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	RALBP1	Q15311	655 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		19.74	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	KDR	P35968	1356 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	FAM182B	Q5T319	152 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	CFAP53	Q96M91	514 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		19.73	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	19.72	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	PPP2R1A	P30153	589 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		19.72	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	NHS	Q6T4R5	1651 aa		19.71	■□□□□ 0.75
PTPA-222	ENST00000445241	BAG6	P46379	1132 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PTPA-222	ENST00000445241	SPG7	Q9UQ90	795 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PTPA-222	ENST00000445241	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		19.7	■□□□□ 0.74
PTPA-222	ENST00000445241	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	19.69	■□□□□ 0.74
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM37	O94972	964 aa		19.68	■□□□□ 0.74
PTPA-222	ENST00000445241	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	19.68	■□□□□ 0.74
PTPA-222	ENST00000445241	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		19.67	■□□□□ 0.74
PTPA-222	ENST00000445241	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
PTPA-222	ENST00000445241	NUDC	Q9Y266	331 aa		19.66	■□□□□ 0.74
PTPA-222	ENST00000445241	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PTPA-222	ENST00000445241	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		19.65	■□□□□ 0.74
PTPA-222	ENST00000445241	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	19.64	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	19.64	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	PLSCR1	O15162	318 aa		19.63	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	19.63	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	BTAF1	O14981	1849 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	CYP27B1	O15528	508 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	APBA3	O96018	575 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	RREB1	Q92766	1687 aa		19.62	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		19.61	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	19.61	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	19.6	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		19.6	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		19.6	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	PHKG2	P15735	406 aa		19.59	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	ITGB4	P16144	1822 aa		19.59	■□□□□ 0.73
PTPA-222	ENST00000445241	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	19.58	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		19.58	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	19.57	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	KCNQ2	O43526	872 aa		19.56	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	FCHSD2	O94868	740 aa		19.56	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	HMOX1	P09601	288 aa		19.56	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		19.56	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	19.56	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		19.56	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	19.55	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		19.55	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	DCAF5	Q96JK2	942 aa		19.55	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		19.55	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	LY75	O60449	1722 aa		19.54	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	19.54	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	19.54	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	19.54	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		19.54	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		19.54	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		19.53	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		19.53	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	19.53	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	19.53	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		19.53	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	19.53	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		19.52	■□□□□ 0.72
PTPA-222	ENST00000445241	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	PRKAR2B	P31323	418 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	19.49	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	ANP32C	O43423	234 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	TXNRD1	Q16881	649 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	MRC1	P22897	1456 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	NEFM	P07197	916 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		19.46	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	MAP3K5	Q99683	1374 aa		19.46	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	NBPF14	Q5TI25	921 aa		19.46	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		19.46	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	PROM2	Q8N271	834 aa		19.46	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	PIGB	Q92521	554 aa		19.46	■□□□□ 0.71
PTPA-222	ENST00000445241	PAPPA	Q13219	1627 aa		19.45	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		19.44	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	PALLD	Q8WX93	1383 aa		19.44	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	19.43	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	CABP4	P57796	275 aa		19.43	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		19.43	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		19.43	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		19.42	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	19.42	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	19.42	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		19.42	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		19.41	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		19.41	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	19.41	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		19.41	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	C5	P01031	1676 aa		19.4	■□□□□ 0.7
PTPA-222	ENST00000445241	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		19.4	■□□□□ 0.7

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