RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445150.3

SRP19-202, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP19, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-202ENST00000445150 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SRP19-202ENST00000445150 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.57■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.57■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 BCL9O00512 1426 aa23.57■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 MEGF6O75095 1541 aa23.56■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.56■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.56■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.56■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 BAG6P46379 1132 aa23.53■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 KDRP35968 1356 aa23.52■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 ANP32CO43423 234 aa23.52■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 TRIM37O94972 964 aa23.52■■□□□ 1.36
SRP19-202ENST00000445150 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.5■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 HMOX1P09601 288 aa23.49■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.49■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 NEFMP07197 916 aa23.47■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.47■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 FCHSD2O94868 740 aa23.46■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 APBA3O96018 575 aa23.46■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.46■■□□□ 1.35
SRP19-202ENST00000445150 CYP27B1O15528 508 aa23.45■■□□□ 1.34
SRP19-202ENST00000445150 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SRP19-202ENST00000445150 PHKG2P15735 406 aa23.44■■□□□ 1.34
SRP19-202ENST00000445150 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SRP19-202ENST00000445150 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.43■■□□□ 1.34
SRP19-202ENST00000445150 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.42■■□□□ 1.34
SRP19-202ENST00000445150 PLSCR1O15162 318 aa23.41■■□□□ 1.34
SRP19-202ENST00000445150 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.41■■□□□ 1.34
SRP19-202ENST00000445150 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SRP19-202ENST00000445150 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.4■■□□□ 1.34
SRP19-202ENST00000445150 DCAF5Q96JK2 942 aa23.4■■□□□ 1.34
SRP19-202ENST00000445150 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.4■■□□□ 1.34
SRP19-202ENST00000445150 PRKAR2BP31323 418 aa23.39■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 KCNQ2O43526 872 aa23.38■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.38■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.36■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.36■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 SBF2Q86WG5 1849 aa23.35■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 NHSQ6T4R5 1651 aa23.35■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.34■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.33■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.33■■□□□ 1.33
SRP19-202ENST00000445150 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.33■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.31■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 CABP4P57796 275 aa23.31■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 EP400Q96L91 3159 aa23.3■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.3■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 NBPF14Q5TI25 921 aa23.29■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.29■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.28■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 MAP3K5Q99683 1374 aa23.27■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 TXNRD1Q16881 649 aa23.27■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.27■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 PIGBQ92521 554 aa23.27■■□□□ 1.32
SRP19-202ENST00000445150 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.26■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 MRS2Q9HD23 443 aa23.26■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.26■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.24■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 RUNDC1Q96C34 613 aa23.24■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.24■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 TEFQ10587 303 aa23.23■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 NFE2L2Q16236 605 aa23.23■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.23■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 BTAF1O14981 1849 aa23.22■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.22■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 LGR6Q9HBX8 967 aa23.22■■□□□ 1.31
SRP19-202ENST00000445150 PALLDQ8WX93 1383 aa23.2■■□□□ 1.3
SRP19-202ENST00000445150 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.2■■□□□ 1.3
SRP19-202ENST00000445150 PROM2Q8N271 834 aa23.2■■□□□ 1.3
SRP19-202ENST00000445150 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SRP19-202ENST00000445150 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.19■■□□□ 1.3
SRP19-202ENST00000445150 IL17REQ8NFR9 667 aa23.18■■□□□ 1.3
SRP19-202ENST00000445150 ATG3Q9NT62 314 aa23.18■■□□□ 1.3
SRP19-202ENST00000445150 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SRP19-202ENST00000445150 STK32BQ9NY57 414 aa23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms