RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.18■■□□□ 1.14
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLKQ9UBT6 870 aa22.18■■□□□ 1.14
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NHSQ6T4R5 1651 aa22.17■■□□□ 1.14
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNQ2O43526 872 aa22.17■■□□□ 1.14
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.17■■□□□ 1.14
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.13■■□□□ 1.13
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.13■■□□□ 1.13
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TXNRD1Q16881 649 aa22.12■■□□□ 1.13
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.11■■□□□ 1.13
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EYA1Q99502 592 aa22.09■■□□□ 1.13
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPG7Q9UQ90 795 aa22.09■■□□□ 1.13
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BTAF1O14981 1849 aa22.08■■□□□ 1.13
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STK32BQ9NY57 414 aa22.08■■□□□ 1.13
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.08■■□□□ 1.12
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRP5O75197 1615 aa22.07■■□□□ 1.12
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.07■■□□□ 1.12
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PROM2Q8N271 834 aa22.06■■□□□ 1.12
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NCAPD2Q15021 1401 aa22.06■■□□□ 1.12
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.02■■□□□ 1.12
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.02■■□□□ 1.12
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CYP27B1O15528 508 aa22.01■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.01■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC15A2Q16348 729 aa22■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.99■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPON1Q9HCB6 807 aa21.99■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.99■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MTHFSP49914 203 aa21.98■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.98■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.98■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PHKG2P15735 406 aa21.94■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.94■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.94■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.94■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.93■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PALLDQ8WX93 1383 aa21.92■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL13P35225 146 aa21.92■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.92■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PAPPAQ13219 1627 aa21.91■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZBTB7AO95365 584 aa21.91■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.91■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LY75O60449 1722 aa21.91■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CASZ1Q86V15 1759 aa21.9■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.9■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNQ4P56696 695 aa21.9■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.9■■□□□ 1.1
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF827Q17R98 1081 aa21.89■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIGBQ92521 554 aa21.88■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CFAP53Q96M91 514 aa21.88■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MTFR1LQ9H019 292 aa21.88■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KDRP35968 1356 aa21.87■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ITGB4P16144 1822 aa21.87■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AKT1S1Q96B36 256 aa21.87■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DCAF5Q96JK2 942 aa21.87■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HMOX1P09601 288 aa21.86■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.84■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MSH5O43196 834 aa21.84■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.83■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CABP4P57796 275 aa21.83■■□□□ 1.09
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.81■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AK7Q96M32 723 aa21.81■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C5P01031 1676 aa21.81■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.8■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.8■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.8■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SIK1P57059 783 aa21.8■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.8■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.8■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUDCQ9Y266 331 aa21.8■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.8■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLD1P28340 1107 aa21.78■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP6V1AP38606 617 aa21.78■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.78■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATG3Q9NT62 314 aa21.78■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPP2R1AP30153 589 aa21.77■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTGER2P43116 358 aa21.77■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms