RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427268.1

FOXD3-AS1-203, FOXD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FOXD3-AS1, Length 491 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.38■□□□□ 0.85
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.37■□□□□ 0.85
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.36■□□□□ 0.85
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 EYA1Q99502 592 aa20.36■□□□□ 0.85
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 BTAF1O14981 1849 aa20.36■□□□□ 0.85
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.33■□□□□ 0.85
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.32■□□□□ 0.84
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 KCNQ2O43526 872 aa20.31■□□□□ 0.84
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.3■□□□□ 0.84
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.3■□□□□ 0.84
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.3■□□□□ 0.84
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PLSCR1O15162 318 aa20.29■□□□□ 0.84
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 MTHFSP49914 203 aa20.29■□□□□ 0.84
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.28■□□□□ 0.84
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.27■□□□□ 0.84
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 IL13P35225 146 aa20.26■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 CYP27B1O15528 508 aa20.25■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 ITGB4P16144 1822 aa20.25■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 KDRP35968 1356 aa20.24■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.24■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 SPG7Q9UQ90 795 aa20.24■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 LY75O60449 1722 aa20.23■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PAPPAQ13219 1627 aa20.22■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 TXNRD1Q16881 649 aa20.21■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.21■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PROM2Q8N271 834 aa20.21■□□□□ 0.83
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PHKG2P15735 406 aa20.18■□□□□ 0.82
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PPP2R1AP30153 589 aa20.18■□□□□ 0.82
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 NBPF14Q5TI25 921 aa20.18■□□□□ 0.82
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.18■□□□□ 0.82
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 LRP5O75197 1615 aa20.17■□□□□ 0.82
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 CASZ1Q86V15 1759 aa20.15■□□□□ 0.82
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 HMOX1P09601 288 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 CFAP53Q96M91 514 aa20.14■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.13■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.12■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 C5P01031 1676 aa20.11■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.11■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.1■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.1■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 STK32BQ9NY57 414 aa20.1■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.1■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PALLDQ8WX93 1383 aa20.09■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.09■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.09■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PIGBQ92521 554 aa20.09■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 DCAF5Q96JK2 942 aa20.09■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.08■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 SLC15A2Q16348 729 aa20.08■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.08■□□□□ 0.81
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 KCNQ4P56696 695 aa20.07■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 ZNF827Q17R98 1081 aa20.06■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.05■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.05■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 NUDCQ9Y266 331 aa20.05■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 MRC1P22897 1456 aa20.05■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 RALBP1Q15311 655 aa20.04■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 AKT1S1Q96B36 256 aa20.04■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.03■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 C4BP0C0L5 1744 aa20.02■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.02■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.02■□□□□ 0.8
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 ATG3Q9NT62 314 aa20.01■□□□□ 0.79
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 PRKAR2BP31323 418 aa20■□□□□ 0.79
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 CABP4P57796 275 aa20■□□□□ 0.79
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
FOXD3-AS1-203ENST00000427268 MAP3K5Q99683 1374 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms