RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.63■■□□□ 1.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RTL1A6NKG5 1358 aa23.62■■□□□ 1.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC37A3O60309 1634 aa23.61■■□□□ 1.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C14orf37Q86TY3 774 aa23.61■■□□□ 1.37
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.58■■□□□ 1.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.58■■□□□ 1.36
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.54■■□□□ 1.36
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 IP6K1Q92551 441 aa23.53■■□□□ 1.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.52■■□□□ 1.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP3K5Q99683 1374 aa23.52■■□□□ 1.36
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.5■■□□□ 1.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.49■■□□□ 1.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ORAI2Q96SN7 254 aa23.49■■□□□ 1.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.48■■□□□ 1.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL17REQ8NFR9 667 aa23.47■■□□□ 1.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP10DQ9P241 1426 aa23.47■■□□□ 1.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLIT3O75094 1523 aa23.46■■□□□ 1.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.45■■□□□ 1.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 G2E3Q7L622 706 aa23.44■■□□□ 1.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP35Q9P2H5 1018 aa23.44■■□□□ 1.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.44■■□□□ 1.34
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 STK31Q9BXU1 1019 aa23.42■■□□□ 1.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCTPP1Q9H773 170 aa23.42■■□□□ 1.34
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEIS3Q99687 375 aa23.41■■□□□ 1.34
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CACNA1FO60840 1977 aa23.4■■□□□ 1.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.4■■□□□ 1.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.4■■□□□ 1.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.4■■□□□ 1.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP85Q6P2H3 762 aa23.4■■□□□ 1.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.4■■□□□ 1.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.39■■□□□ 1.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F6X3S4 739 aa23.39■■□□□ 1.33
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.37■■□□□ 1.33
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 FLIIQ13045 1269 aa23.36■■□□□ 1.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.36■■□□□ 1.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.36■■□□□ 1.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.35■■□□□ 1.33
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFKBIBQ15653 356 aa23.34■■□□□ 1.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MST1RQ04912 1400 aa23.34■■□□□ 1.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NECTIN2Q92692 538 aa23.34■■□□□ 1.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCL11AQ9H165 835 aa23.34■■□□□ 1.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALS2Q96Q42 1657 aa23.33■■□□□ 1.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEKHG5O94827 1062 aa23.33■■□□□ 1.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.33■■□□□ 1.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.32■■□□□ 1.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LGR6Q9HBX8 967 aa23.32■■□□□ 1.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.32■■□□□ 1.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.31■■□□□ 1.32
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