RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.35■■□□□ 1.49
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SEMA3B-201ENST00000416295 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.33■■□□□ 1.49
SEMA3B-201ENST00000416295 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SEMA3B-201ENST00000416295 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SEMA3B-201ENST00000416295 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SEMA3B-201ENST00000416295 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.32■■□□□ 1.48
SEMA3B-201ENST00000416295 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.32■■□□□ 1.48
SEMA3B-201ENST00000416295 LRP5O75197 1615 aa24.32■■□□□ 1.48
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SEMA3B-201ENST00000416295 IL13P35225 146 aa24.31■■□□□ 1.48
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SEMA3B-201ENST00000416295 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
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SEMA3B-201ENST00000416295 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.29■■□□□ 1.48
SEMA3B-201ENST00000416295 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-201ENST00000416295 PPP2R1AP30153 589 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-201ENST00000416295 CFAP53Q96M91 514 aa24.27■■□□□ 1.48
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SEMA3B-201ENST00000416295 RREB1Q92766 1687 aa24.27■■□□□ 1.48
SEMA3B-201ENST00000416295 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
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SEMA3B-201ENST00000416295 KDRP35968 1356 aa24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-201ENST00000416295 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-201ENST00000416295 KCNQ2O43526 872 aa24.24■■□□□ 1.47
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SEMA3B-201ENST00000416295 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.24■■□□□ 1.47
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SEMA3B-201ENST00000416295 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.23■■□□□ 1.47
SEMA3B-201ENST00000416295 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.23■■□□□ 1.47
SEMA3B-201ENST00000416295 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SEMA3B-201ENST00000416295 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.23■■□□□ 1.47
SEMA3B-201ENST00000416295 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-201ENST00000416295 CYP27B1O15528 508 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-201ENST00000416295 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.21■■□□□ 1.47
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 RALBP1Q15311 655 aa24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 HMOX1P09601 288 aa24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 PHKG2P15735 406 aa24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 NUDCQ9Y266 331 aa24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 BTAF1O14981 1849 aa24.14■■□□□ 1.46
SEMA3B-201ENST00000416295 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-201ENST00000416295 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-201ENST00000416295 TXNRD1Q16881 649 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-201ENST00000416295 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-201ENST00000416295 DCAF5Q96JK2 942 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-201ENST00000416295 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-201ENST00000416295 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
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SEMA3B-201ENST00000416295 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-201ENST00000416295 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-201ENST00000416295 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.08■■□□□ 1.45
SEMA3B-201ENST00000416295 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.06■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 FCHSD2O94868 740 aa24.04■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 PRKAR2BP31323 418 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 PIGBQ92521 554 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 ITGB4P16144 1822 aa24.03■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.02■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 SPON1Q9HCB6 807 aa24.02■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 PALLDQ8WX93 1383 aa24.02■■□□□ 1.44
SEMA3B-201ENST00000416295 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SEMA3B-201ENST00000416295 CABP4P57796 275 aa24■■□□□ 1.43
SEMA3B-201ENST00000416295 LY75O60449 1722 aa24■■□□□ 1.43
SEMA3B-201ENST00000416295 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.99■■□□□ 1.43
SEMA3B-201ENST00000416295 STK32BQ9NY57 414 aa23.99■■□□□ 1.43
SEMA3B-201ENST00000416295 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SEMA3B-201ENST00000416295 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
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SEMA3B-201ENST00000416295 MAP3K5Q99683 1374 aa23.97■■□□□ 1.43
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SEMA3B-201ENST00000416295 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.96■■□□□ 1.43
SEMA3B-201ENST00000416295 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SEMA3B-201ENST00000416295 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SEMA3B-201ENST00000416295 CASZ1Q86V15 1759 aa23.96■■□□□ 1.43
SEMA3B-201ENST00000416295 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.95■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC15A2Q16348 729 aa23.95■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.95■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.94■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 KCNQ4P56696 695 aa23.93■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.93■■□□□ 1.42
SEMA3B-201ENST00000416295 LGR6Q9HBX8 967 aa23.93■■□□□ 1.42
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