RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409664.5

CSRNP3-204, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 3, human

TSL 5

Gene CSRNP3, Length 482 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRNP3-204	ENST00000409664	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	12.09	□□□□□ -0.47
CSRNP3-204	ENST00000409664	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CSRNP3-204	ENST00000409664	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CSRNP3-204	ENST00000409664	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	AFF2	P51816	1311 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	ZNF521	Q96K83	1311 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	CRB1	P82279	1406 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	NEUROD2	Q15784	382 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	VPS72	Q15906	364 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	USP35	Q9P2H5	1018 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	USP21	Q9UK80	565 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	MEGF6	O75095	1541 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	NFE2L2	Q16236	605 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	DISP2	A7MBM2	1401 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	RIPK4	P57078	832 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	DCTN1	Q14203	1278 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	WWC1	Q8IX03	1113 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	CYP27B1	O15528	508 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	LGR6	Q9HBX8	967 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	IL2RB	P14784	551 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	ATRN	O75882	1429 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CSRNP3-204	ENST00000409664	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	CCDC27	Q2M243	656 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	MCM10	Q7L590	875 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	GLI3	P10071	1580 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	PHKG2	P15735	406 aa		12	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		12	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	POTEA	Q6S8J7	498 aa		12	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		12	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	SLFN5	Q08AF3	891 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	ZNF853	P0CG23	659 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	WDR63	Q8IWG1	891 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	NGEF	Q8N5V2	710 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	SPG7	Q9UQ90	795 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	EXOC5	O00471	708 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	NEFM	P07197	916 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	GOLGA2	Q08379	1002 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	RNF39	Q9H2S5	420 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CSRNP3-204	ENST00000409664	MAP3K5	Q99683	1374 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	CHL1	O00533	1208 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	KCNQ3	O43525	872 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	DDB1	Q16531	1140 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	FAM182B	Q5T319	152 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CSRNP3-204	ENST00000409664	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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