RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
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PTPRN-202ENST00000409251 USP25Q9UHP3 1055 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-202ENST00000409251 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-202ENST00000409251 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-202ENST00000409251 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-202ENST00000409251 KIF16BQ96L93 1317 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-202ENST00000409251 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-202ENST00000409251 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-202ENST00000409251 SIRT1Q96EB6 747 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRN-202ENST00000409251 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRN-202ENST00000409251 TSHZ3Q63HK5 1081 aa15.77■□□□□ 0.12
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