RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 RARSP54136 660 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 NUTM2GQ5VZR2 741 aa5.15□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 C14orf37Q86TY3 774 aa5.15□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa5.15□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ADGRB2O60241 1585 aa5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 DIP2AQ14689 1571 aa5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 NFE2L2Q16236 605 aa5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 SULT6B1Q6IMI4 303 aa5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 PANK1Q8TE04 598 aa5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.14□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC21AQ8NDW8 1320 aa5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 FANCIQ9NVI1 1328 aa5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAMTSL3P82987 1691 aa5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 SEC24BO95487 1268 aa5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 COG6Q9Y2V7 657 aa5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 MON2Q7Z3U7 1717 aa5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 CAMK2BQ13554 666 aa5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ESCO1Q5FWF5 840 aa5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 AEBP1Q8IUX7 1158 aa5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ABTB2Q8N961 1025 aa5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 CLUAP1Q96AJ1 413 aa5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 PHF8Q9UPP1 1060 aa5.13□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ITSN1Q15811 1721 aa5.13□□□□□ -1.59
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LRRTM4-201ENST00000409088 PDE3AQ14432 1141 aa5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 TNNQ9UQP3 1299 aa5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 IL16Q14005 1332 aa5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP3K19Q56UN5 1328 aa5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 AKAP12Q02952 1782 aa5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 OVOS2Q6IE36 1432 aa5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 SSH2Q76I76 1423 aa5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 SKAP1Q86WV1 359 aa5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC7Q96NW7 1537 aa5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 PSME1Q06323 249 aa5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 SMC4Q9NTJ3 1288 aa5.12□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM83GA6ND36 823 aa5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 DCTN1Q14203 1278 aa5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 USP31Q70CQ4 1352 aa5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKARQ7Z5J8 1434 aa5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 RLBP1P12271 317 aa5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ORAI2Q96SN7 254 aa5.11□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB7CA1YPR0 619 aa5.1□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXO3O43524 673 aa5.1□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 GNAI1P63096 354 aa5.1□□□□□ -1.59
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LRRTM4-201ENST00000409088 LMOD3Q0VAK6 560 aa5.1□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.1□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ERICH6Q7L0X2 663 aa5.1□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
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LRRTM4-201ENST00000409088 MYT1Q01538 1121 aa5.1□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 LMOD2Q6P5Q4 547 aa5.1□□□□□ -1.59
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LRRTM4-201ENST00000409088 FLT4P35916 1363 aa5.1□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
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LRRTM4-201ENST00000409088 IFT57Q9NWB7 429 aa5.09□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHDP01880 384 aa5.09□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXC9P31274 260 aa5.09□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP44Q96MT7 982 aa5.09□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
LRRTM4-201ENST00000409088 VAMP4O75379 141 aa5.09□□□□□ -1.6
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF853P0CG23 659 aa5.09□□□□□ -1.6
LRRTM4-201ENST00000409088 MS4A1P11836 297 aa5.09□□□□□ -1.6
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM27P14373 513 aa5.09□□□□□ -1.6
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