RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 FKBP8Q14318 412 aa26.23■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.23■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.21■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 MAP3K5Q99683 1374 aa26.21■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.2■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 EVA1CP58658 441 aa26.2■■□□□ 1.79
ODC1-202ENST00000405333 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 ZNF853P0CG23 659 aa26.19■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.19■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 IL17REQ8NFR9 667 aa26.18■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 MBIPQ9NS73 344 aa26.18■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 CRB1P82279 1406 aa26.18■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 IFT57Q9NWB7 429 aa26.18■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.17■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 NEFLP07196 543 aa26.17■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 CFAP44Q96MT7 982 aa26.17■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 HSPA1LP34931 641 aa26.16■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 USP35Q9P2H5 1018 aa26.16■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 GNAI1P63096 354 aa26.16■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.16■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.16■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 LRRC37A3O60309 1634 aa26.16■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 JCADQ9P266 1359 aa26.15■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 PLIN1O60240 522 aa26.15■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 LGR6Q9HBX8 967 aa26.14■■□□□ 1.78
ODC1-202ENST00000405333 BCAR3O75815 825 aa26.14■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.14■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.12■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.12■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 CHL1O00533 1208 aa26.11■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.11■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.1■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 TSPYL6Q8N831 410 aa26.1■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.1■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 NRAPQ86VF7 1730 aa26.09■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.09■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.09■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 KRT24Q2M2I5 525 aa26.08■■□□□ 1.77
ODC1-202ENST00000405333 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 LRP6O75581 1613 aa26.07■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.07■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 SPG7Q9UQ90 795 aa26.07■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 CYP27B1O15528 508 aa26.06■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 IL2RBP14784 551 aa26.06■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.768e-9■■□□□ 13.5
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ODC1-202ENST00000405333 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.05■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
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ODC1-202ENST00000405333 SLIT2O94813 1529 aa26.04■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.04■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.03■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.03■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.02■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 VAMP4O75379 141 aa26.02■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
ODC1-202ENST00000405333 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.01■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.01■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 SSH1Q8WYL5 1049 aa26■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 NGLY1Q96IV0 654 aa26■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 TEFQ10587 303 aa25.98■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 DISP2A7MBM2 1401 aa25.97■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.97■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.97■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.97■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.97■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.96■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 KCNQ3O43525 872 aa25.96■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.96■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.96■■□□□ 1.75
ODC1-202ENST00000405333 TNNQ9UQP3 1299 aa25.95■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.94■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.93■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.93■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 BTBD11A6QL63 1104 aa25.93■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.93■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 DCAF5Q96JK2 942 aa25.93■■□□□ 1.74
ODC1-202ENST00000405333 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
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