RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 ERLIN2O94905 339 aa21.83■■□□□ 1.09
USP25-204ENST00000400183 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.83■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.83■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 PAF1Q8N7H5 531 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 RAI14Q9P0K7 980 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 SLFN5Q08AF3 891 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 SKIDA1Q1XH10 827 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 RAPGEF3O95398 923 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 WASF1Q92558 559 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 DAPK1P53355 1430 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 CCDC181Q5TID7 509 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 CCDC66A2RUB6 948 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 ESPNB1AK53 854 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.77■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.77■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 CCDC184Q52MB2 194 aa21.77■■□□□ 1.08
USP25-204ENST00000400183 IFT140Q96RY7 1462 aa21.77■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 MCM4P33991 863 aa21.76■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.76■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 GOLGA6L10A6NI86 522 aa21.76■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.76■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 STARD3NLO95772 234 aa21.76■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 AIDAQ96BJ3 306 aa21.76■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 TSPYL1Q9H0U9 437 aa21.76■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.76■■□□□ 1.07
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USP25-204ENST00000400183 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.75■■□□□ 1.07
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USP25-204ENST00000400183 NEFHP12036 1026 aa21.75■■□□□ 1.07
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USP25-204ENST00000400183 ERLIN1O75477 346 aa21.74■■□□□ 1.07
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USP25-204ENST00000400183 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 RAB11FIP3O75154 756 aa21.74■■□□□ 1.07
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USP25-204ENST00000400183 MPNDQ8N594 471 aa21.73■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 SMTNL1A8MU46 457 aa21.73■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 MX1P20591 662 aa21.73■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.73■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 METTL24Q5JXM2 366 aa21.72■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 PRXQ9BXM0 1461 aa21.72■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 UQCRHP07919 91 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 ABCF2Q9UG63 623 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 DDX11Q96FC9 970 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-204ENST00000400183 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 MCM10Q7L590 875 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 MAP3K11Q16584 847 aa21.7■■□□□ 1.06
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USP25-204ENST00000400183 ABCC11Q96J66 1382 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 ZNF76P36508 570 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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USP25-204ENST00000400183 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 SYNJ1O43426 1573 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 TIAM1Q13009 1591 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
USP25-204ENST00000400183 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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