RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395787.3

APIP-201, Transcript of APAF1 interacting protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APIP, Length 1,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIP-201ENST00000395787 NHSQ6T4R5 1651 aa26.14■■□□□ 1.77
APIP-201ENST00000395787 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
APIP-201ENST00000395787 MEGF6O75095 1541 aa26.12■■□□□ 1.77
APIP-201ENST00000395787 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.11■■□□□ 1.77
APIP-201ENST00000395787 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.11■■□□□ 1.77
APIP-201ENST00000395787 KCNQ2O43526 872 aa26.1■■□□□ 1.77
APIP-201ENST00000395787 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
APIP-201ENST00000395787 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.08■■□□□ 1.77
APIP-201ENST00000395787 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 BTAF1O14981 1849 aa26.07■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 EYA1Q99502 592 aa26.06■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.05■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.05■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.04■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 SPG7Q9UQ90 795 aa26.03■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 TXNRD1Q16881 649 aa26.02■■□□□ 1.76
APIP-201ENST00000395787 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
APIP-201ENST00000395787 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26■■□□□ 1.75
APIP-201ENST00000395787 NCAPD2Q15021 1401 aa25.99■■□□□ 1.75
APIP-201ENST00000395787 PROM2Q8N271 834 aa25.97■■□□□ 1.75
APIP-201ENST00000395787 MTHFSP49914 203 aa25.95■■□□□ 1.75
APIP-201ENST00000395787 STK32BQ9NY57 414 aa25.95■■□□□ 1.75
APIP-201ENST00000395787 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.75
APIP-201ENST00000395787 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.95■■□□□ 1.74
APIP-201ENST00000395787 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.95■■□□□ 1.74
APIP-201ENST00000395787 CYP27B1O15528 508 aa25.94■■□□□ 1.74
APIP-201ENST00000395787 LRP5O75197 1615 aa25.92■■□□□ 1.74
APIP-201ENST00000395787 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.91■■□□□ 1.74
APIP-201ENST00000395787 ITGB4P16144 1822 aa25.91■■□□□ 1.74
APIP-201ENST00000395787 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
APIP-201ENST00000395787 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.9■■□□□ 1.74
APIP-201ENST00000395787 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.89■■□□□ 1.74
APIP-201ENST00000395787 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.89■■□□□ 1.74
APIP-201ENST00000395787 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
APIP-201ENST00000395787 IL13P35225 146 aa25.88■■□□□ 1.73
APIP-201ENST00000395787 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.88■■□□□ 1.73
APIP-201ENST00000395787 LY75O60449 1722 aa25.87■■□□□ 1.73
APIP-201ENST00000395787 SLC15A2Q16348 729 aa25.87■■□□□ 1.73
APIP-201ENST00000395787 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.87■■□□□ 1.73
APIP-201ENST00000395787 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
APIP-201ENST00000395787 PHKG2P15735 406 aa25.86■■□□□ 1.73
APIP-201ENST00000395787 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
APIP-201ENST00000395787 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.85■■□□□ 1.73
APIP-201ENST00000395787 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.84■■□□□ 1.73
APIP-201ENST00000395787 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
APIP-201ENST00000395787 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.82■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 SPON1Q9HCB6 807 aa25.82■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.82■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.82■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.82■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 CFAP53Q96M91 514 aa25.82■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 KDRP35968 1356 aa25.8■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 PAPPAQ13219 1627 aa25.79■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 CASZ1Q86V15 1759 aa25.79■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 HMOX1P09601 288 aa25.79■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 KCNQ4P56696 695 aa25.79■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 PIGBQ92521 554 aa25.78■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 DCAF5Q96JK2 942 aa25.78■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 PALLDQ8WX93 1383 aa25.78■■□□□ 1.72
APIP-201ENST00000395787 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.76■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.75■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 ZNF827Q17R98 1081 aa25.75■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 ZBTB7AO95365 584 aa25.74■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.74■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 C5P01031 1676 aa25.73■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 PPP2R1AP30153 589 aa25.73■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 CABP4P57796 275 aa25.73■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 AKT1S1Q96B36 256 aa25.73■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 NUDCQ9Y266 331 aa25.72■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.72■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 MTFR1LQ9H019 292 aa25.7■■□□□ 1.71
APIP-201ENST00000395787 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.69■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.69■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.69■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.69■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 MSH5O43196 834 aa25.68■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.67■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 SIK1P57059 783 aa25.67■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.66■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 ATG3Q9NT62 314 aa25.66■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 AK7Q96M32 723 aa25.65■■□□□ 1.7
APIP-201ENST00000395787 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.6 ms