RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375980.8

EFHD2-201, Transcript of EF-hand domain family member D2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFHD2, Length 2,419 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2-201ENST00000375980 FANCAO15360 1455 aa24.65■■□□□ 1.54
EFHD2-201ENST00000375980 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
EFHD2-201ENST00000375980 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.64■■□□□ 1.54
EFHD2-201ENST00000375980 FGD1P98174 961 aa24.64■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 FYB1O15117 783 aa24.63■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 REC8O95072 547 aa24.63■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 ADCY5O95622 1261 aa24.63■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.62■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 MBIPQ9NS73 344 aa24.61■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 ERC2O15083 957 aa24.61■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.61■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 ADGRB3O60242 1522 aa24.6■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 KIF20AO95235 890 aa24.6■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.6■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.6■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 FCHSD2O94868 740 aa24.6■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 IGSF3O75054 1194 aa24.59■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.59■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.59■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 FBLN1P23142 703 aa24.59■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 USP48Q86UV5 1035 aa24.59■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.59■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 PHF14O94880 888 aa24.58■■□□□ 1.53
EFHD2-201ENST00000375980 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 HMOX1P09601 288 aa24.57■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.57■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 UVSSAQ2YD98 709 aa24.57■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 CUL4AQ13619 759 aa24.56■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.56■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 NFE2L2Q16236 605 aa24.55■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.55■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.55■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 ATP10DQ9P241 1426 aa24.55■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 GNAI1P63096 354 aa24.55■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 PALD1Q9ULE6 856 aa24.55■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 CEP85Q6P2H3 762 aa24.54■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 IFT57Q9NWB7 429 aa24.54■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 PLCB2Q00722 1185 aa24.53■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 PPLO60437 1756 aa24.53■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 ZNF853P0CG23 659 aa24.52■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.52■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 GLI2P10070 1586 aa24.52■■□□□ 1.52
EFHD2-201ENST00000375980 KRT24Q2M2I5 525 aa24.51■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 NPATQ14207 1427 aa24.51■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.51■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.51■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 KCNF1Q9H3M0 494 aa24.51■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.5■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 MCM2P49736 904 aa24.5■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.5■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.5■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 ANKRD7Q92527 254 aa24.5■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 KDM4AO75164 1064 aa24.49■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 KIAA1524Q8TCG1 905 aa24.49■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 ASXL2Q76L83 1435 aa24.49■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 AP5Z1O43299 807 aa24.49■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 STK26Q9P289 416 aa24.49■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.47■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.47■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 FAM83GA6ND36 823 aa24.46■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.46■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.46■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 GGT6Q6P531 493 aa24.46■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 MEIS3Q99687 375 aa24.46■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.46■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.46■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 MX1P20591 662 aa24.45■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 PDE1AP54750 535 aa24.45■■□□□ 1.51
EFHD2-201ENST00000375980 RTL1A6NKG5 1358 aa24.45■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 SPC24Q8NBT2 197 aa24.45■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.45■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 MSH6P52701 1360 aa24.45■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.44■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 DCTN1Q14203 1278 aa24.44■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 POLKQ9UBT6 870 aa24.44■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.43■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 CTIFO43310 598 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.43■■□□□ 1.5
EFHD2-201ENST00000375980 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms