RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360059.5

GTPBP4-201, Transcript of GTP binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene GTPBP4, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4-201ENST00000360059 RREB1Q92766 1687 aa26.09■■□□□ 1.77
GTPBP4-201ENST00000360059 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
GTPBP4-201ENST00000360059 PLSCR1O15162 318 aa26.08■■□□□ 1.77
GTPBP4-201ENST00000360059 NHSQ6T4R5 1651 aa26.08■■□□□ 1.77
GTPBP4-201ENST00000360059 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
GTPBP4-201ENST00000360059 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
GTPBP4-201ENST00000360059 EYA1Q99502 592 aa26.07■■□□□ 1.76
GTPBP4-201ENST00000360059 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.07■■□□□ 1.76
GTPBP4-201ENST00000360059 NCAPD2Q15021 1401 aa26.06■■□□□ 1.76
GTPBP4-201ENST00000360059 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.05■■□□□ 1.76
GTPBP4-201ENST00000360059 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
GTPBP4-201ENST00000360059 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.05■■□□□ 1.76
GTPBP4-201ENST00000360059 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
GTPBP4-201ENST00000360059 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GTPBP4-201ENST00000360059 PROM2Q8N271 834 aa26■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.99■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.99■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 NBPF14Q5TI25 921 aa25.99■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.98■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 BTAF1O14981 1849 aa25.98■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.97■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.97■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 TXNRD1Q16881 649 aa25.97■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 CYP27B1O15528 508 aa25.96■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.96■■□□□ 1.75
GTPBP4-201ENST00000360059 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.94■■□□□ 1.74
GTPBP4-201ENST00000360059 MTHFSP49914 203 aa25.94■■□□□ 1.74
GTPBP4-201ENST00000360059 SPG7Q9UQ90 795 aa25.94■■□□□ 1.74
GTPBP4-201ENST00000360059 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
GTPBP4-201ENST00000360059 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.743e-6■■□□□ 13.3
GTPBP4-201ENST00000360059 IL13P35225 146 aa25.9■■□□□ 1.74
GTPBP4-201ENST00000360059 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.88■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.87■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 PHKG2P15735 406 aa25.85■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.85■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.85■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.85■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 LRP5O75197 1615 aa25.85■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.84■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 STK32BQ9NY57 414 aa25.84■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 KDRP35968 1356 aa25.83■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
GTPBP4-201ENST00000360059 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.82■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 PAPPAQ13219 1627 aa25.81■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 SLC15A2Q16348 729 aa25.81■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.81■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.8■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.8■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 KCNQ4P56696 695 aa25.79■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 LY75O60449 1722 aa25.79■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 ITGB4P16144 1822 aa25.77■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 HMOX1P09601 288 aa25.77■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 PIGBQ92521 554 aa25.77■■□□□ 1.72
GTPBP4-201ENST00000360059 ZNF827Q17R98 1081 aa25.76■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 CASZ1Q86V15 1759 aa25.75■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 PALLDQ8WX93 1383 aa25.75■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 PPP2R1AP30153 589 aa25.74■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.74■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 AKT1S1Q96B36 256 aa25.73■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 DCAF5Q96JK2 942 aa25.73■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.72■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 CFAP53Q96M91 514 aa25.72■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 SPON1Q9HCB6 807 aa25.71■■□□□ 1.71
GTPBP4-201ENST00000360059 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4-201ENST00000360059 ZBTB7AO95365 584 aa25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4-201ENST00000360059 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.68■■□□□ 1.7
GTPBP4-201ENST00000360059 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.66■■□□□ 1.7
GTPBP4-201ENST00000360059 CABP4P57796 275 aa25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4-201ENST00000360059 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4-201ENST00000360059 ATG3Q9NT62 314 aa25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4-201ENST00000360059 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
GTPBP4-201ENST00000360059 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
GTPBP4-201ENST00000360059 C5P01031 1676 aa25.64■■□□□ 1.69
GTPBP4-201ENST00000360059 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4-201ENST00000360059 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4-201ENST00000360059 ANP32CO43423 234 aa25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4-201ENST00000360059 SIK1P57059 783 aa25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4-201ENST00000360059 NUDCQ9Y266 331 aa25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4-201ENST00000360059 MTFR1LQ9H019 292 aa25.62■■□□□ 1.69
GTPBP4-201ENST00000360059 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.62■■□□□ 1.69
GTPBP4-201ENST00000360059 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.61■■□□□ 1.69
GTPBP4-201ENST00000360059 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
GTPBP4-201ENST00000360059 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
GTPBP4-201ENST00000360059 PTGER2P43116 358 aa25.6■■□□□ 1.69
GTPBP4-201ENST00000360059 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.6■■□□□ 1.69
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