RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 PHACTR3Q96KR7 559 aa23■■□□□ 1.27
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PRPF39-201ENST00000355765 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.99■■□□□ 1.27
PRPF39-201ENST00000355765 BRD1O95696 1058 aa22.99■■□□□ 1.27
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF428Q96B54 188 aa22.99■■□□□ 1.27
PRPF39-201ENST00000355765 CFAP44Q96MT7 982 aa22.99■■□□□ 1.27
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PRPF39-201ENST00000355765 KIF3AQ9Y496 699 aa22.98■■□□□ 1.27
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PRPF39-201ENST00000355765 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.97■■□□□ 1.27
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PRPF39-201ENST00000355765 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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PRPF39-201ENST00000355765 USP48Q86UV5 1035 aa22.94■■□□□ 1.26
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PRPF39-201ENST00000355765 NFE2L2Q16236 605 aa22.92■■□□□ 1.26
PRPF39-201ENST00000355765 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.92■■□□□ 1.26
PRPF39-201ENST00000355765 GNAI1P63096 354 aa22.91■■□□□ 1.26
PRPF39-201ENST00000355765 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.91■■□□□ 1.26
PRPF39-201ENST00000355765 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.91■■□□□ 1.26
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PRPF39-201ENST00000355765 PALD1Q9ULE6 856 aa22.91■■□□□ 1.26
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PRPF39-201ENST00000355765 ADGRB3O60242 1522 aa22.9■■□□□ 1.26
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PRPF39-201ENST00000355765 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.9■■□□□ 1.26
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PRPF39-201ENST00000355765 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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PRPF39-201ENST00000355765 ZNF853P0CG23 659 aa22.84■■□□□ 1.25
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PRPF39-201ENST00000355765 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.84■■□□□ 1.25
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PRPF39-201ENST00000355765 PDE1AP54750 535 aa22.82■■□□□ 1.24
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PRPF39-201ENST00000355765 POLKQ9UBT6 870 aa22.82■■□□□ 1.24
PRPF39-201ENST00000355765 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.81■■□□□ 1.24
PRPF39-201ENST00000355765 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PRPF39-201ENST00000355765 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.8■■□□□ 1.24
PRPF39-201ENST00000355765 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.8■■□□□ 1.24
PRPF39-201ENST00000355765 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.8■■□□□ 1.24
PRPF39-201ENST00000355765 DTNBO60941 627 aa22.8■■□□□ 1.24
PRPF39-201ENST00000355765 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.8■■□□□ 1.24
PRPF39-201ENST00000355765 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
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