RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 KIAA0232Q92628 1395 aa22.31■■□□□ 1.16
KRCC1-201ENST00000347055 PTPRCP08575 1304 aa22.31■■□□□ 1.16
KRCC1-201ENST00000347055 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
KRCC1-201ENST00000347055 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.3■■□□□ 1.16
KRCC1-201ENST00000347055 RBSNQ9H1K0 784 aa22.3■■□□□ 1.16
KRCC1-201ENST00000347055 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.3■■□□□ 1.16
KRCC1-201ENST00000347055 RGS12O14924 1447 aa22.29■■□□□ 1.16
KRCC1-201ENST00000347055 CABP1Q9NZU7 370 aa22.28■■□□□ 1.16
KRCC1-201ENST00000347055 STK26Q9P289 416 aa22.28■■□□□ 1.16
KRCC1-201ENST00000347055 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.28■■□□□ 1.16
KRCC1-201ENST00000347055 ERC2O15083 957 aa22.27■■□□□ 1.16
KRCC1-201ENST00000347055 IL17RAQ96F46 866 aa22.27■■□□□ 1.16
KRCC1-201ENST00000347055 DYNC1I1O14576 645 aa22.26■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 SDSP20132 328 aa22.26■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 RICTORQ6R327 1708 aa22.26■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 CEP85Q6P2H3 762 aa22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 GPT2Q8TD30 523 aa22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 SSH2Q76I76 1423 aa22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 RTL1A6NKG5 1358 aa22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 AK9Q5TCS8 1911 aa22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 HMMRO75330 724 aa22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 ANAPC15P60006 121 aa22.24■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.23■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 PHF14O94880 888 aa22.22■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 CUL4AQ13619 759 aa22.22■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.22■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 HMOX1P09601 288 aa22.21■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.21■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 AKAP12Q02952 1782 aa22.21■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 C3P01024 1663 aa22.2■■□□□ 1.15
KRCC1-201ENST00000347055 BRD1O95696 1058 aa22.2■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 MCCP23508 829 aa22.2■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.2■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.19■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 PKP1Q13835 747 aa22.18■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 UVSSAQ2YD98 709 aa22.18■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 ARHGEF10O15013 1369 aa22.18■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 MSH6P52701 1360 aa22.18■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 ITSN1Q15811 1721 aa22.17■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 CHL1O00533 1208 aa22.17■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.16■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 UQCRHP07919 91 aa22.16■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 TSPY26PQ9H489 355 aa22.16■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.15■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 TMX3Q96JJ7 454 aa22.15■■□□□ 1.14
KRCC1-201ENST00000347055 SYCE3A1L190 88 aa22.14■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 COG3Q96JB2 828 aa22.13■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.13■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 AOX1Q06278 1338 aa22.13■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 PDE1AP54750 535 aa22.12■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.12■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.12■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.12■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.12■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 SIRT1Q96EB6 747 aa22.12■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 NEK4P51957 841 aa22.1■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.1■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.1■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.1■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.1■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 TECPR2O15040 1411 aa22.09■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 MEIS3Q99687 375 aa22.08■■□□□ 1.13
KRCC1-201ENST00000347055 CPS1P31327 1500 aa22.08■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.08■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.07■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.07■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 STAP2Q9UGK3 403 aa22.07■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 CRB1P82279 1406 aa22.06■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 PLEKHG5O94827 1062 aa22.06■■□□□ 1.12
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